; convert-matrix  -v 1 -i W6/regulonW6.rm.fna.peaks-rm/results/oligos_5-7nt/peaks_oligos-2str-noov_5-7nt_mvk2_2_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -return sites -o W6/regulonW6.rm.fna.peaks-rm/results/oligos_5-7nt/peaks_oligos-2str-noov_5-7nt_mvk2_2_pssm_count_matrices.txt
; Input files
;	input	W6/regulonW6.rm.fna.peaks-rm/results/oligos_5-7nt/peaks_oligos-2str-noov_5-7nt_mvk2_2_pssm_count_matrices.tf
; Input format        	transfac
; Output files
;	output	W6/regulonW6.rm.fna.peaks-rm/results/oligos_5-7nt/peaks_oligos-2str-noov_5-7nt_mvk2_2_pssm_count_matrices.txt
; Output format       	tab
; pseudo-weight       	1
a	7	9	2	2	23	1	27	1	1	27	28	3	0	14	11	13
c	8	5	21	24	1	26	0	27	27	1	1	25	28	9	12	9
g	6	5	4	0	3	1	1	0	1	0	0	0	0	3	4	3
t	8	10	2	3	2	1	1	1	0	1	0	1	1	3	2	4
//
; Sites	29
>site_0
GTCCACTCCAACCTCT
>site_1
TACTACATCAACCACT
>site_2
CACTACACCAACCGCC
>site_3
GCCCGCACCAACCGCC
>site_4
CGCCACACCAATCCCA
>site_5
TTCCACACCAAACCAA
>site_6
AGTCACACCAACCAGC
>site_7
GTCCTCACCAACCCAA
>site_8
TACACCACCAACCACA
>site_9
AGCAACACCAACCCTT
>site_10
ATGTACACCAACCAGC
>site_11
ATACACAACAACCAAA
>site_12
CATCACGCCAACCAAA
>site_13
TGCCACACCAAACTCC
>site_14
CACCACACCCACCTGC
>site_15
CTCCACACCACCCGCC
>site_16
GTGCACACCAACCACC
>site_17
CAGCACACCTACCAAA
>site_18
TCGCTCACCAACCACA
>site_19
TACCGCACCAACCAAT
>site_20
CACCACACGAACCACG
>site_21
ACCCACACCAACTAAA
>site_22
CACCGCACCAACCCGA
>site_23
ACCCATACCAACCCCG
>site_24
GTCCACACCAAACCAA
>site_25
TTCCAGACCAACCCAA
>site_26
TGCCACACAAACCATA
>site_27
ACACAAACCAACCAAG
>site_28
GTCCACACCAACCCAC
a	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	1	0	0	0	0	0	0	1	0
c	0	0	1	1	1	1	0	1	1	0	0	1	0	0	0	1	1	0	0	0	1
g	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	0	0	1	1	0	0
t	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0
//
; Sites	1
>site_0
AACCCCACCGACAGTCCGGAC
a	1	1	1	0	6	0	6	0	0	0	1	0	0	2	0	2
c	3	3	3	6	0	6	1	7	0	0	0	1	0	1	3	1
g	2	3	1	0	1	0	0	0	7	0	6	0	7	3	3	3
t	1	0	2	1	0	1	0	0	0	7	0	6	0	1	1	1
//
; Sites	7
>site_0
GCCTACCCGTGTGGGA
>site_1
ACGCACACGTATGGCG
>site_2
CGCCATACGTGTGCGT
>site_3
CCTCACACGTGCGGCC
>site_4
GGCCGCACGTGTGAGG
>site_5
CAACACACGTGTGACA
>site_6
TGTCACACGTGTGTTG
a	9	10	9	1	4	43	2	1	43	44	0	2	34	14	15
c	18	9	8	38	13	1	42	44	0	0	45	43	4	16	16
g	6	10	19	3	4	0	1	0	0	1	0	0	3	12	8
t	12	16	9	3	24	1	0	0	2	0	0	0	4	3	6
//
; Sites	45
>site_0
GTGTGACCAACCAAG
>site_1
GCGCCACCAACCAAA
>site_2
TCTCTACCAACAACC
>site_3
ACTCCACCAACCACA
>site_4
CGACGACCAACCAAC
>site_5
CTGTCACCAACCACT
>site_6
AGGAAACCAACCACC
>site_7
CTACTCCCAACCAAC
>site_8
TCCCTACCAACAACC
>site_9
ATTCTACCAACCTTG
>site_10
GAGCTACCAACCTGC
>site_11
CTGCTAACAACCATT
>site_12
CAGCCACCAACCGCG
>site_13
TCTCCACCAACCAAA
>site_14
ATTCTACCAACCAAG
>site_15
GTACTACCAACCTAC
>site_16
CTTCCACCAACCACC
>site_17
GCTCCACCAACCACA
>site_18
TGGCCACCAACCCCA
>site_19
ACACCACCAACCACA
>site_20
TGGCGACCAACCGCT
>site_21
CACCAACCAACCAGG
>site_22
TGGCGACCAACCCTC
>site_23
CTGGCACCAACCAGC
>site_24
CACGTACCAACCACA
>site_25
CTACTACCAACCCGA
>site_26
AACCAACCAACCAGA
>site_27
TTGCTACCAACCAAA
>site_28
TTCCTACCTACCAGA
>site_29
TACCTACCTACCAGG
>site_30
CCCCTACCAACCTGC
>site_31
CAGTCACCAACCAAC
>site_32
CTACTACCAACCAGC
>site_33
TAGCTACCAACCAAT
>site_34
CACCTACCAGCCACA
>site_35
TGGCTAACAACCAAG
>site_36
AGAGTACCAACCAAT
>site_37
CGTCTACCAACCAAT
>site_38
CGGCTAGCAACCACC
>site_39
ATGCTACAAACCAAA
>site_40
CGACTTCCAACCAGA
>site_41
GTGCTACCAACCGGA
>site_42
ATTCAACCAACCAGC
>site_43
CAGCCACCAACCCCG
>site_44
TCACCACCAACCACC
a	93	90	256	256	0	0	0	256	76	88
c	58	44	0	0	0	0	0	0	43	28
g	44	56	0	0	0	0	0	0	54	49
t	61	66	0	0	256	256	256	0	83	91
//
; Sites	256
>site_0
AGAATTTATA
>site_1
AGAATTTATA
>site_2
ATAATTTATT
>site_3
AAAATTTAAA
>site_4
CAAATTTACA
>site_5
TCAATTTATT
>site_6
TGAATTTAGC
>site_7
AAAATTTATA
>site_8
ACAATTTACG
>site_9
AGAATTTACA
>site_10
CTAATTTATC
>site_11
CTAATTTATT
>site_12
TTAATTTATT
>site_13
GGAATTTAGT
>site_14
GAAATTTAAG
>site_15
CAAATTTAGC
>site_16
GGAATTTAAC
>site_17
TTAATTTACA
>site_18
TTAATTTATT
>site_19
TGAATTTATT
>site_20
TGAATTTATG
>site_21
GCAATTTACT
>site_22
GTAATTTATA
>site_23
TCAATTTATA
>site_24
CAAATTTAGT
>site_25
AGAATTTAAG
>site_26
TCAATTTATA
>site_27
CAAATTTATA
>site_28
TGAATTTAAA
>site_29
CAAATTTAAG
>site_30
CAAATTTAAA
>site_31
GAAATTTATA
>site_32
AAAATTTAGA
>site_33
AGAATTTAGG
>site_34
GGAATTTACT
>site_35
CAAATTTATT
>site_36
GTAATTTACT
>site_37
ATAATTTATG
>site_38
CTAATTTATT
>site_39
GAAATTTAAT
>site_40
CTAATTTAAT
>site_41
CTAATTTAGG
>site_42
CAAATTTACA
>site_43
TTAATTTATG
>site_44
TCAATTTATT
>site_45
TTAATTTAAT
>site_46
AAAATTTAAT
>site_47
TCAATTTATT
>site_48
GTAATTTAAG
>site_49
AAAATTTAAA
>site_50
CTAATTTACA
>site_51
AAAATTTAAT
>site_52
AGAATTTATG
>site_53
GGAATTTACA
>site_54
GCAATTTAGT
>site_55
AAAATTTAAC
>site_56
CAAATTTAAA
>site_57
ACAATTTAGA
>site_58
CAAATTTATC
>site_59
CAAATTTATC
>site_60
GTAATTTATG
>site_61
TTAATTTATT
>site_62
GCAATTTATA
>site_63
AGAATTTATA
>site_64
GAAATTTAGA
>site_65
TCAATTTAAA
>site_66
GGAATTTAAT
>site_67
ATAATTTACG
>site_68
GGAATTTACA
>site_69
AAAATTTATA
>site_70
GAAATTTACA
>site_71
TTAATTTATT
>site_72
AGAATTTAAA
>site_73
ATAATTTAGG
>site_74
ATAATTTAGC
>site_75
AAAATTTAGA
>site_76
AGAATTTAGG
>site_77
AAAATTTAAA
>site_78
GAAATTTAAA
>site_79
ATAATTTATT
>site_80
AGAATTTATG
>site_81
AGAATTTATG
>site_82
AAAATTTAAA
>site_83
GGAATTTAAG
>site_84
CTAATTTACA
>site_85
TGAATTTATT
>site_86
GAAATTTAAA
>site_87
ATAATTTATA
>site_88
CAAATTTAGC
>site_89
TGAATTTACT
>site_90
GTAATTTATT
>site_91
AGAATTTATA
>site_92
GAAATTTAGA
>site_93
TTAATTTACT
>site_94
CAAATTTAAA
>site_95
CAAATTTAGT
>site_96
TGAATTTATG
>site_97
TGAATTTAAT
>site_98
CTAATTTAGA
>site_99
CAAATTTATA
>site_100
CTAATTTAAT
>site_101
AAAATTTATC
>site_102
GAAATTTATA
>site_103
AAAATTTACT
>site_104
CAAATTTAGT
>site_105
CCAATTTACA
>site_106
CAAATTTATT
>site_107
CAAATTTAAC
>site_108
GGAATTTAAT
>site_109
CTAATTTAAG
>site_110
CAAATTTAAA
>site_111
AGAATTTATT
>site_112
AGAATTTAAA
>site_113
AGAATTTACT
>site_114
ACAATTTATG
>site_115
CGAATTTACC
>site_116
GAAATTTAAT
>site_117
GAAATTTACG
>site_118
AGAATTTAGG
>site_119
TGAATTTACC
>site_120
TAAATTTAGA
>site_121
TAAATTTAAA
>site_122
ATAATTTAAT
>site_123
AGAATTTAGA
>site_124
ACAATTTACG
>site_125
TTAATTTAGG
>site_126
TTAATTTAGC
>site_127
TCAATTTAAT
>site_128
TAAATTTAGT
>site_129
TAAATTTAAG
>site_130
ACAATTTAAT
>site_131
GTAATTTAAG
>site_132
TTAATTTATA
>site_133
GTAATTTAAT
>site_134
CTAATTTAAT
>site_135
TCAATTTAAA
>site_136
CGAATTTATG
>site_137
TCAATTTATT
>site_138
CCAATTTACC
>site_139
AGAATTTAAA
>site_140
AAAATTTATT
>site_141
CTAATTTATA
>site_142
TCAATTTACT
>site_143
AAAATTTAGT
>site_144
TCAATTTAAT
>site_145
ATAATTTATC
>site_146
AGAATTTACA
>site_147
ATAATTTAAG
>site_148
ACAATTTAAT
>site_149
AGAATTTAGT
>site_150
AAAATTTAGT
>site_151
CCAATTTAAA
>site_152
ATAATTTATC
>site_153
AAAATTTAGG
>site_154
CAAATTTATT
>site_155
ACAATTTAGG
>site_156
GAAATTTATA
>site_157
AAAATTTACC
>site_158
GCAATTTATT
>site_159
TTAATTTAGT
>site_160
TTAATTTAGA
>site_161
AGAATTTATT
>site_162
TCAATTTAGT
>site_163
GAAATTTATA
>site_164
AAAATTTAAG
>site_165
AGAATTTAAA
>site_166
ACAATTTAGA
>site_167
GAAATTTACA
>site_168
AGAATTTATA
>site_169
TGAATTTATT
>site_170
TGAATTTATT
>site_171
AAAATTTAGA
>site_172
CAAATTTAAT
>site_173
AAAATTTATT
>site_174
CAAATTTAAG
>site_175
TCAATTTAGG
>site_176
ATAATTTAAT
>site_177
CGAATTTACC
>site_178
ACAATTTACT
>site_179
CAAATTTAAG
>site_180
CGAATTTATG
>site_181
ATAATTTAAG
>site_182
TTAATTTAAG
>site_183
TTAATTTAGA
>site_184
TCAATTTACT
>site_185
CCAATTTAAT
>site_186
TCAATTTAGA
>site_187
TGAATTTATC
>site_188
AAAATTTAGA
>site_189
CAAATTTAAT
>site_190
AAAATTTAAT
>site_191
GTAATTTAAC
>site_192
GTAATTTAAC
>site_193
CAAATTTAAT
>site_194
ATAATTTAGA
>site_195
CAAATTTAAA
>site_196
TAAATTTAGA
>site_197
TAAATTTATA
>site_198
ACAATTTAGG
>site_199
TAAATTTATC
>site_200
TAAATTTAAG
>site_201
AGAATTTAAA
>site_202
TCAATTTACG
>site_203
GGAATTTACA
>site_204
AAAATTTAGA
>site_205
AAAATTTATC
>site_206
CAAATTTAGT
>site_207
CAAATTTACG
>site_208
CTAATTTAGT
>site_209
ATAATTTAAT
>site_210
TTAATTTAAA
>site_211
CCAATTTATT
>site_212
ACAATTTACA
>site_213
TAAATTTATT
>site_214
TAAATTTAAA
>site_215
TTAATTTAGT
>site_216
TGAATTTAAT
>site_217
AAAATTTACA
>site_218
CAAATTTACA
>site_219
GAAATTTATT
>site_220
GGAATTTAAT
>site_221
TTAATTTAGG
>site_222
GAAATTTAAA
>site_223
CAAATTTAGA
>site_224
ACAATTTATA
>site_225
ACAATTTACA
>site_226
AAAATTTAAT
>site_227
TTAATTTACT
>site_228
AGAATTTAGA
>site_229
CAAATTTATA
>site_230
AGAATTTATT
>site_231
ACAATTTAAA
>site_232
TCAATTTATG
>site_233
CTAATTTAAC
>site_234
TTAATTTATA
>site_235
GAAATTTAAA
>site_236
GTAATTTACT
>site_237
AGAATTTAGT
>site_238
AGAATTTAGG
>site_239
CAAATTTATC
>site_240
GAAATTTATG
>site_241
ATAATTTAAC
>site_242
ATAATTTATT
>site_243
ACAATTTACT
>site_244
AAAATTTAGT
>site_245
AAAATTTATA
>site_246
ATAATTTATT
>site_247
ACAATTTAGT
>site_248
ACAATTTATT
>site_249
CTAATTTATG
>site_250
TTAATTTAAG
>site_251
CCAATTTAGG
>site_252
AGAATTTATA
>site_253
GTAATTTATT
>site_254
GTAATTTACT
>site_255
CAAATTTACC
; Host name	baobab.eead.csic.es
; Job started	2021-02-18.111328
; Job done	2021-02-18.111328
; Seconds	0.17
;	user	0.17
;	system	0.02
;	cuser	0
;	csystem	0