#1) Ajustar en RSAT_config.bashrc numeros de version

#2) Obtener lista de genomas disponibles
#wget ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-25/species_EnsemblPlants.txt
#cat species_EnsemblPlants.txt | grep -v "^#" | cut -f 2 > plants_to_install.txt
#edita la lista como sea preciso, al menos para el 
#download-ensembl-genome -db ensemblgenomes -available_species | grep plants > plants_to_install.txt # faltan algunos no marcados como plantas

# 3) editar lista, descargar e instalar
#install-ensembl-genome  -species_file plants_to_install.txt -db ensemblgenomes -version 78 -v 2

# actualizacion anual de vmatch
make -f makefiles/install_software.mk install_vmatch

# instalacion de weblogo
cd $RSAT; make -f makefiles/install_software.mk  install_weblogo3

# eliminar genomas
cd $RSAT; install-organism -task uninstall -org xxx #lo quita de la lista
cd $RSAT; install-organism -task erase -org xxxx #lo borra 
# o con una lista en un archivo
#install-organism -task uninstall,erase -org_file genomes_to_remove.txt

install-organism -task uninstall,erase -org_file genomes2remove.23102018.txt

# actualizar todo soft 
make -f makefiles/install_rsat.mk update 

# 21022019 cpan -i Parallel::ForkManager MCE::Shared