; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/03/15/oligo-analysis_2025-03-15.182925_M2n9FB_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/03/15/oligo-analysis_2025-03-15.182925_M2n9FB_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/03/15/oligo-analysis_2025-03-15.182925_M2n9FB_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/03/15/oligo-analysis_2025-03-15.182925_M2n9FB_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 603 638 632 777 742 791 795 385 620 780 784 708 423 374 444 550 324 351 397
c 45 70 127 15 0 3 1 3 1 4 4 3 12 14 16 157 51 152 175
g 15 5 4 2 9 2 4 24 133 13 6 7 47 306 45 28 29 65 81
t 141 91 41 10 53 8 4 392 50 7 10 86 322 110 299 69 400 236 151
//
a 339 108 7 0 0 0 93 12 0 2 65 190 111
c 2228 2075 3623 3968 65 4036 7 963 4032 3877 1977 1227 263
g 198 1484 5 0 20 0 69 3061 1 61 70 2482 2725
t 1272 370 402 69 3952 1 3868 1 4 97 1925 138 938
//
a 18 83 0 0 0 0 0 0 1717 25
c 716 27 1895 0 1895 1895 0 1895 25 1723
g 1138 1714 0 0 0 0 0 0 24 108
t 23 71 0 1895 0 0 1895 0 129 39
//
a 126 115 149 222 214 144 161 12 202 71 83 15 8 51 97 88
c 6 10 10 4 0 1 0 12 8 2 6 5 0 24 12 14
g 14 12 24 0 5 6 2 8 12 0 1 0 4 10 10 6
t 88 97 51 8 15 83 71 202 12 161 144 214 222 149 115 126
//
a 240 186 566 478 19 69 386 78 10 14 28 15 237 91
c 50 56 25 6 4 6 48 15 4 122 8 8 74 36
g 96 209 7 8 63 2 5 4 2 17 13 1 24 150
t 425 360 213 319 725 734 372 714 795 658 762 787 476 534
//
a 137 1653 1 0 29 0 2955 3 179 44 16
c 4373 964 4704 4808 11 4725 1781 4795 946 1730 4498
g 122 273 103 1 15 75 29 10 5 312 122
t 179 1921 3 2 4756 11 46 3 3681 2725 175
//
a 105 107 100 152 148 156 136 74 126 153 40 117 64 63 34 27 30 109 80
c 7 8 8 3 5 2 1 2 0 1 4 0 2 5 4 2 8 9 17
g 8 4 3 1 4 4 0 4 7 1 9 4 5 7 5 6 12 14 9
t 44 45 53 8 7 2 27 84 31 9 111 43 93 89 121 129 114 32 58
//
a 3583 3737 4071 4012 4081 4097 4094 3696 4081 4109 4087 3488 3656 3677
c 158 76 2 2 4 1 1 11 3 4 8 49 55 69
g 58 32 8 8 14 10 8 67 23 8 6 94 178 191
t 339 293 57 116 39 30 35 364 31 17 37 507 249 201
//
a 3 109 5 3 0 0 221 0 222 0 1 96 2
c 121 3 21 218 75 1 2 0 1 3 108 6 97
g 94 106 97 2 1 224 1 225 2 0 104 17 122
t 7 7 102 2 149 0 1 0 0 222 12 106 4
//
a 139 309 2 662 1 134 19 3 563 202 241
c 148 113 686 6 668 3 102 690 22 262 311
g 295 136 6 24 10 58 573 2 107 223 20
t 113 137 1 3 16 500 1 0 3 8 123
//
a 1453 79 316 1 2669 0 2562 3 10 95 1303
c 254 592 2 31 1 1 29 1273 185 597 26
g 784 1791 2342 2636 2 2671 80 1301 2343 1835 571
t 181 210 12 4 0 0 1 95 134 145 772
//
a 15 2 173 0 173 0 173 0 3 7
c 2 20 0 0 0 173 0 0 4 1
g 136 21 0 173 0 0 0 0 149 135
t 20 130 0 0 0 0 0 173 17 30
//
a 6 8 14 0 14 0 14 0 2 3
c 2 2 0 0 0 0 0 0 2 3
g 3 2 0 0 0 0 0 0 2 2
t 3 2 0 14 0 14 0 14 8 6
//
a 656 613 1083 1012 957 1023 1089 254 236 559 660
c 116 99 4 2 1 3 6 7 6 164 102
g 188 260 13 14 132 70 4 7 19 160 99
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//
a 75 103 218 26 234 64 186 71 4 2 0 361 1 3 1 3 54 84 57
c 51 40 16 12 24 268 17 6 3 2 127 18 3 3 1 2 19 6 11
g 173 139 29 128 5 5 25 0 3 0 1 6 2 3 1 14 143 29 35
t 255 272 291 388 291 217 326 477 544 550 426 169 548 545 551 535 338 435 451
//
a 102 31 402 0 0 0 0 0 99 220
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//
a 183 128 360 367 19 357 284 4 10 225 54
c 154 148 3 0 5 5 16 1 3 19 7
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t 16 13 1 1 3 2 67 361 132 90 209
//
a 4 39 0 0 0 0 0 0 6 108
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//
a 99 26 129 135 15 3 129 4 5 91 78
c 7 13 1 0 0 1 3 0 62 9 14
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//
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