; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/03/26/oligo-analysis_2025-03-26.205032_3m9kva_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/03/26/oligo-analysis_2025-03-26.205032_3m9kva_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/03/26/oligo-analysis_2025-03-26.205032_3m9kva_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/03/26/oligo-analysis_2025-03-26.205032_3m9kva_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 63 63 81 67 53 40 4 159 179 6 173 1 8 10 15 52 82 57 64 57
c 35 33 22 20 56 31 3 10 1 0 3 1 5 165 96 21 13 22 22 27
g 27 22 22 13 21 96 165 5 1 3 0 1 10 3 31 56 20 22 33 35
t 57 64 57 82 52 15 10 8 1 173 6 179 159 4 40 53 67 81 63 63
//
a 77 95 111 35 88 183 14 192 187 10 188 173 34 121 104
c 15 23 18 9 10 3 6 2 5 1 5 4 11 31 18
g 74 35 26 143 89 5 178 7 3 186 6 12 138 22 40
t 35 48 46 14 14 10 3 0 6 4 2 12 18 27 39
//
a 79 85 100 96 82 124 8 175 206 6 205 4 15 4 14 62 93 55 64 76
c 42 41 28 20 26 30 1 20 3 3 5 1 6 198 129 32 18 19 23 30
g 34 23 31 49 60 42 196 12 2 4 1 2 11 3 30 49 26 29 55 32
t 59 65 55 49 46 18 9 7 3 201 3 207 182 9 41 71 77 111 72 76
//
a 46 97 191 1 194 1 5 4 17 129 77 72
c 12 53 1 3 0 1 8 181 120 16 25 29
g 108 23 2 10 0 4 146 5 15 10 22 29
t 30 23 2 182 2 190 37 6 44 41 72 66
//
a 120 68 213 23 222 20 219 11 207 55 69 81 100
c 30 21 3 7 0 3 0 4 2 61 20 29 19
g 34 103 3 195 4 200 4 208 9 71 111 65 54
t 44 36 9 3 2 5 5 5 10 41 28 53 55
//
a 108 206 435 19 430 2 40 33 27 124 137
c 52 73 1 6 13 10 263 378 14 99 79
g 199 59 3 8 4 5 44 10 13 48 49
t 99 120 19 425 11 441 111 37 404 187 193
//
a 91 88 78 76 6 198 227 9 222 2 11 6 18 64 102 64 77 77
c 35 35 55 69 5 17 4 1 4 0 2 218 127 36 29 29 24 37
g 32 29 29 61 212 10 1 3 0 1 9 1 39 56 25 26 48 37
t 75 81 71 27 10 8 1 220 7 230 211 8 49 77 77 114 84 82
//
a 66 72 85 76 61 42 7 169 198 7 190 2 11 4 17 109 78 65
c 37 36 35 21 55 34 3 16 1 2 3 1 10 187 112 21 26 24
g 29 26 27 25 26 109 181 6 1 1 1 4 15 2 32 27 18 29
t 68 66 53 78 58 15 9 9 0 190 6 193 164 7 39 43 78 82
//
a 8 16 0 0 38 0 0 38 13 13
c 2 8 38 0 0 38 0 0 11 6
g 11 6 0 38 0 0 38 0 6 11
t 17 8 0 0 0 0 0 0 8 8
//
a 183 170 326 335 367 366 347 47 57 351 182 191
c 63 57 17 18 6 3 8 15 13 4 37 44
g 51 77 21 22 8 12 12 303 298 11 67 59
t 88 81 21 10 4 4 18 20 17 19 99 91
//
a 11 6 0 0 0 33 0 0 15 10
c 7 12 33 33 33 0 33 33 5 9
g 6 4 0 0 0 0 0 0 7 7
t 9 11 0 0 0 0 0 0 6 7
//
a 47 61 2 133 4 6 17 7 132 47 52
c 28 24 6 0 5 6 113 129 1 20 17
g 30 18 113 1 2 117 2 4 4 11 31
t 37 39 21 8 131 13 10 2 5 64 42
//
a 98 110 106 70 9 213 254 5 246 1 16 10 18 82 111 72 75 76
c 37 29 38 36 4 22 1 1 4 1 9 231 133 32 25 25 31 38
g 42 39 39 132 239 11 1 6 1 2 24 5 43 56 27 34 62 51
t 81 80 75 20 6 12 2 246 7 254 209 12 64 88 95 127 90 93
//
a 12 20 38 38 0 0 0 38 15 17
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g 8 1 0 0 0 38 38 0 8 2
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//
a 120 144 151 28 278 283 22 293 286 28 287 146 102
c 33 37 40 10 4 6 2 6 5 8 11 29 39
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t 51 72 71 6 6 8 6 2 10 14 3 76 64
//
a 120 144 151 28 278 283 22 293 286 28 287 146 102
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//
a 101 107 106 99 10 221 258 8 255 3 13 10 19 78 108 77 91 91
c 39 38 45 75 3 21 5 1 4 0 8 246 157 42 32 35 29 41
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//
a 60 66 75 89 79 55 43 6 157 179 7 175 1 6 8 12 53 88 53 64 59
c 28 32 32 24 29 55 32 2 10 1 1 3 1 4 168 97 25 17 21 23 26
g 44 28 21 22 17 21 91 166 9 1 3 0 1 7 2 33 50 15 20 38 36
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//
a 164 225 50 417 361 423 47 423 54 239 173
c 55 60 19 4 10 7 20 3 11 46 58
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t 108 88 22 10 7 6 11 15 21 84 97
//
a 22 22 7 3 1 6 0 0 0 3 22 22
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