; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/04/06/dyad-analysis_2025-04-06.121035_pptxS6_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/04/06/dyad-analysis_2025-04-06.121035_pptxS6_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/04/06/dyad-analysis_2025-04-06.121035_pptxS6_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/04/06/dyad-analysis_2025-04-06.121035_pptxS6_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 62 57 184 184 0 67 67 53 60 66 64 58 60 52 68 64 58 71 49 35 0 0 0 61 65
c 22 40 0 0 0 29 21 31 36 30 31 37 40 39 28 28 37 27 35 51 0 0 184 32 38
g 49 44 0 0 184 26 34 47 27 32 42 33 23 26 27 24 34 22 41 26 0 0 0 22 27
t 51 43 0 0 0 62 62 53 61 56 47 56 61 67 61 68 55 64 59 72 184 184 0 69 54
//
a 195 166 417 417 417 417 417 0 176 170
c 54 67 0 0 0 0 0 0 62 47
g 80 101 0 0 0 0 0 417 73 74
t 88 83 0 0 0 0 0 0 106 126
//
a 123 120 308 308 308 116 125 127 116 128 109 113 108 105 120 118 109 109 106 106 104 82 93 0 0 0 84 88
c 52 54 0 0 0 56 55 36 36 38 48 43 45 49 46 37 46 38 38 35 45 50 31 0 0 0 46 52
g 53 57 0 0 0 57 47 47 47 53 48 55 55 50 56 42 42 42 62 46 45 48 55 0 308 0 62 52
t 80 77 0 0 0 79 81 98 109 89 103 97 100 104 86 111 111 119 102 121 114 128 129 308 0 308 116 116
//
a 100 90 0 243 243 111 85 74 86 92 91 94 97 85 90 82 105 94 89 86 243 0 243 82 103
c 36 43 243 0 0 34 38 38 39 36 38 36 40 44 49 35 38 39 28 34 0 0 0 39 31
g 35 46 0 0 0 31 45 45 37 42 41 26 40 36 38 45 28 28 36 44 0 0 0 33 37
t 72 64 0 0 0 67 75 86 81 73 73 87 66 78 66 81 72 82 90 79 0 243 0 89 72
//
a 180 198 464 464 464 175 175 180 198 171 200 152 185 0 464 0 163 145
c 83 98 0 0 0 87 83 69 55 74 54 61 61 0 0 0 71 58
g 69 68 0 0 0 66 73 70 84 63 73 80 66 0 0 0 73 66
t 132 100 0 0 0 136 133 145 127 156 137 171 152 464 0 464 157 195
//
a 596 633 1340 1340 1340 720 665 729 1340 1340 1340 625 590
c 231 257 0 0 0 183 203 185 0 0 0 178 186
g 221 214 0 0 0 212 203 221 0 0 0 246 215
t 292 236 0 0 0 225 269 205 0 0 0 291 349
//
a 48 46 0 0 0 46 57 55 61 52 46 63 52 59 66 60 68 68 0 166 166 61 72
c 22 31 0 0 0 22 20 26 26 30 25 23 24 33 22 28 24 17 0 0 0 22 25
g 35 34 0 166 0 36 39 28 34 35 32 33 36 22 30 41 38 31 166 0 0 41 23
t 61 55 166 0 166 62 50 57 45 49 63 47 54 52 48 37 36 50 0 0 0 42 46
//
a 90 88 0 0 0 78 85 83 97 102 91 109 102 114 124 109 120 121 118 133 127 138 311 311 311 124 126
c 59 37 0 0 0 44 39 46 54 51 47 45 51 43 36 42 46 41 51 49 49 50 0 0 0 46 57
g 50 47 0 311 0 54 48 45 49 40 56 40 61 46 54 56 51 48 52 36 57 60 0 0 0 62 39
t 112 139 311 0 311 135 139 137 111 118 117 117 97 108 97 104 94 101 90 93 78 63 0 0 0 79 89
//
a 207 202 564 0 0 148 179 179 208 202 194 195 226 222 218 219 231 230 221 215 564 564 564 240 211
c 88 89 0 0 0 94 92 96 86 74 95 93 89 87 72 99 75 82 101 105 0 0 0 87 112
g 79 100 0 0 0 111 81 93 92 79 94 80 71 90 109 81 82 91 89 101 0 0 0 92 76
t 190 173 0 564 564 211 212 196 178 209 181 196 178 165 165 165 176 161 153 143 0 0 0 145 165
//
a 57 42 0 152 0 64 41 43 45 67 54 57 46 56 45 51 64 50 56 47 48 63 152 152 152 56 48
c 30 30 152 0 0 27 23 22 37 14 20 28 30 25 40 25 18 27 31 27 39 25 0 0 0 23 41
g 27 25 0 0 152 25 34 33 24 21 45 29 32 26 31 37 20 28 32 41 29 34 0 0 0 42 23
t 38 55 0 0 0 36 54 54 46 50 33 38 44 45 36 39 50 47 33 37 36 30 0 0 0 31 40
//
; Host name rsat
; Job started 2025-04-06.121043
; Job done 2025-04-06.121043
; Seconds 0.11
; user 0.11
; system 0.01
; cuser 0
; csystem 0