; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/04/23/oligo-analysis_2025-04-23.101112_xvUtev_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/04/23/oligo-analysis_2025-04-23.101112_xvUtev_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/04/23/oligo-analysis_2025-04-23.101112_xvUtev_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/04/23/oligo-analysis_2025-04-23.101112_xvUtev_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 72 72 31 33 19 21 18 32 8 18 17 19 26 48 33 86 75
c 101 92 76 209 27 312 25 40 326 25 17 313 17 199 75 101 105
g 136 128 197 101 299 18 295 267 12 294 303 17 287 73 215 124 133
t 49 66 54 15 13 7 20 19 12 21 21 9 28 38 35 47 45
//
a 143 132 356 23 31 757 11 27 777 25 38 361 135
c 225 396 162 61 810 28 27 810 26 31 780 148 218
g 367 213 159 757 25 35 825 33 33 793 34 171 371
t 145 139 203 39 14 60 17 10 44 31 28 200 156
//
a 64 63 48 37 17 9 35 14 13 16 23 19 31 39 75 64
c 125 132 213 42 334 19 305 341 24 36 341 22 282 92 122 139
g 139 122 92 282 22 341 36 24 341 305 19 334 42 213 132 125
t 64 75 39 31 19 23 16 13 14 35 9 17 37 48 63 64
//
a 107 126 34 29 50 15 32 37 15 36 51 31 127 113
c 159 179 486 27 466 527 24 89 526 16 459 104 166 205
g 233 135 38 493 29 30 508 63 25 506 38 422 198 122
t 89 148 30 39 43 16 24 399 22 30 40 31 97 148
//
a 227 176 24 872 45 45 39 43 29 317 187
c 234 338 963 52 897 52 39 939 966 182 350
g 306 291 62 57 37 918 931 56 50 321 280
t 298 260 16 84 86 50 56 27 20 245 248
//
a 270 283 27 45 1092 55 42 76 43 289 347
c 318 342 1163 58 57 56 70 1064 1080 300 286
g 430 256 50 1165 54 1109 1094 55 90 445 338
t 258 395 36 8 73 56 70 81 63 242 305
//
a 21 22 9 4 9 4 3 7 9 5 11 7 14 9 7 9 10 5 13 62 17 21
c 44 43 46 30 17 111 23 10 107 22 8 104 89 5 106 95 5 99 83 13 48 44
g 44 48 13 83 99 5 95 106 5 89 104 8 22 107 10 23 111 17 30 46 43 44
t 21 17 62 13 5 10 9 7 9 14 7 11 5 9 7 3 4 9 4 9 22 21
//
a 45 44 19 18 19 15 21 11 16 14 10 12 23 12 21 25 18 53 41
c 112 104 169 210 205 19 222 239 15 221 239 19 81 234 27 200 62 105 120
g 81 83 81 35 32 236 27 23 241 29 22 241 145 21 213 34 173 91 76
t 46 53 15 21 28 14 14 11 12 20 13 12 35 17 23 25 31 35 47
//
a 52 36 16 139 9 4 23 5 7 19 13 7 37 30 54 67
c 65 83 170 42 218 4 211 242 12 27 225 13 157 60 87 79
g 78 89 56 46 13 242 14 8 238 191 10 234 38 137 86 66
t 63 50 16 31 18 8 10 3 1 21 10 4 26 31 31 46
//
a 132 305 31 14 149 6 15 692 17 27 302 149
c 407 141 42 852 28 37 846 35 21 804 156 216
g 216 156 804 21 35 846 37 28 852 42 141 407
t 149 302 27 17 692 15 6 149 14 31 305 132
//
a 101 151 31 19 61 11 7 488 8 34 197 104
c 193 95 439 503 12 20 535 22 15 487 106 165
g 141 130 60 15 25 510 13 13 520 16 97 184
t 122 181 27 20 459 16 2 34 14 20 157 104
//
a 90 92 13 13 374 10 17 28 19 23 136 81
c 96 111 378 6 30 14 10 372 36 29 115 122
g 164 108 34 410 12 395 391 10 344 367 107 155
t 79 118 4 0 13 10 11 19 30 10 71 71
//
a 277 310 26 60 121 37 43 1048 40 271 325
c 333 347 1239 64 53 1238 60 76 1170 321 297
g 505 381 46 1154 1086 30 1224 162 82 505 430
t 231 308 35 68 86 41 19 60 54 249 294
//
a 108 113 32 17 539 14 18 24 13 30 205 124
c 181 149 502 20 15 38 528 20 548 34 131 185
g 185 131 34 548 20 528 38 15 20 502 149 181
t 124 205 30 13 24 18 14 539 17 32 113 108
//
a 65 70 32 20 17 19 34 22 14 37 16 18 154 41 23 95 80
c 93 100 123 28 34 336 18 21 333 14 13 324 51 46 248 91 89
g 167 142 54 322 313 9 311 323 17 312 338 27 122 245 65 131 154
t 54 67 170 9 15 15 16 13 15 16 12 10 52 47 43 62 56
//
a 46 204 14 13 350 3 8 377 10 14 320 27 24 192 55
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g 88 66 344 19 18 370 16 10 381 14 27 162 40 70 196
t 46 78 16 7 32 15 7 13 9 5 38 32 25 92 74
//
a 54 70 95 17 10 302 6 11 304 6 17 310 7 67 148
c 106 159 23 221 317 13 16 323 15 22 319 12 23 174 60
g 128 70 203 103 26 19 327 18 16 311 12 9 314 71 65
t 68 57 35 15 3 22 7 4 21 17 8 25 12 44 83
//
a 50 33 10 5 1 2 162 6 6 156 12 40 46
c 40 54 154 6 169 4 3 164 4 5 151 45 34
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t 46 46 9 164 3 7 9 5 1 8 8 35 53
//
a 81 44 26 153 44 23 13 19 16 13 16 13 21 20 16 56 56 39
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g 114 110 49 92 197 33 305 20 29 316 32 22 284 30 198 68 88 104
t 62 67 25 46 38 17 17 15 14 11 32 15 24 33 36 36 72 58
//
a 269 302 38 74 108 42 48 1075 40 314 325
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