; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/07/23/oligo-analysis_2025-07-23.083439_9Zeess_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/07/23/oligo-analysis_2025-07-23.083439_9Zeess_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/07/23/oligo-analysis_2025-07-23.083439_9Zeess_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/07/23/oligo-analysis_2025-07-23.083439_9Zeess_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 715 684 869 949 458 1027 437 490 426 1094 428 1098 1116 392 1123 427 1094 1074 1070 436 551 1079 457 312 1192 354 1175 382 1152 367 463 1042 1091 445 445 1076 1092 925 537 983 529 685 708
c 148 158 100 123 115 86 106 77 93 72 86 69 74 65 59 62 65 75 68 85 71 58 63 59 52 59 58 69 68 45 65 85 74 90 92 65 69 85 84 94 105 110 136
g 149 121 104 100 83 80 81 85 68 75 65 77 53 56 65 61 69 47 72 74 65 66 76 57 62 38 68 45 50 60 83 51 63 64 85 83 57 111 86 98 86 154 141
t 640 689 579 480 996 459 1028 1000 1065 411 1073 408 409 1139 405 1102 424 456 442 1057 965 449 1056 1224 346 1201 351 1156 382 1180 1041 474 424 1053 1030 428 434 531 945 477 932 703 667
//
a 1388 1217 1154 1009 2712 407 2718 400 2722 405 2518 2309 529 2507 479 2523 1004 2137 818 2024 974 1427 1304
c 340 340 261 758 84 134 74 107 71 125 112 120 146 99 137 97 606 169 226 192 263 280 315
g 313 300 295 192 79 80 99 61 90 73 108 134 118 127 101 122 216 198 171 236 238 329 282
t 1159 1343 1490 1241 325 2579 309 2632 317 2597 462 637 2407 467 2483 458 1374 696 1985 748 1725 1164 1299
//
a 801 962 736 1777 271 1833 292 1820 290 1690 1562 343 1724 298 1716 635 1528 452 1516 463 1463 765 706 822 901
c 218 188 211 72 81 48 84 52 75 78 76 98 60 99 63 428 113 119 109 141 101 169 116 182 206
g 212 249 333 75 62 69 48 61 56 71 92 87 77 60 89 122 102 96 127 107 145 373 158 229 233
t 925 757 876 232 1742 206 1732 223 1735 317 426 1628 295 1699 288 971 413 1489 404 1445 447 849 1176 923 816
//
a 760 614 698 568 605 280 1335 277 1344 250 1347 278 707 900 750 897 1344 302 1366 284 1337 845 1302 359 1311 342 850 338 1290 319 1333 463 1238 363 1254 409 1184 580 845 578
c 186 168 157 254 93 99 63 67 45 51 45 61 61 67 81 79 50 59 49 55 55 64 45 65 58 71 58 59 54 101 50 260 62 79 70 106 73 237 119 169
g 133 135 124 113 98 68 61 50 58 45 53 47 57 44 55 66 49 54 52 45 55 36 70 48 72 56 72 66 80 57 69 98 71 81 82 104 90 142 153 177
t 658 820 758 802 941 1290 278 1343 290 1391 292 1351 912 726 851 695 294 1322 270 1353 290 792 320 1265 296 1268 757 1274 313 1260 285 916 366 1214 331 1118 390 778 620 813
//
a 620 588 743 447 459 802 748 781 397 848 368 431 360 922 361 916 950 298 955 315 953 861 886 360 458 895 380 262 1020 284 988 312 1013 282 397 896 960 361 373 875 896 540 620 590
c 124 129 107 83 91 77 75 94 85 73 82 60 66 69 69 55 63 66 56 61 55 73 67 56 53 51 60 50 48 64 51 53 43 39 63 56 63 72 70 64 80 174 103 127
g 100 87 85 97 85 84 79 80 75 80 63 74 47 72 51 60 48 50 55 50 59 41 52 59 51 52 51 50 50 28 63 36 51 59 60 49 51 65 70 75 66 113 103 107
t 544 584 453 761 753 425 486 433 831 387 875 823 915 325 907 357 327 974 322 962 321 413 383 913 826 390 897 1026 270 1012 286 987 281 1008 868 387 314 890 875 374 346 561 562 564
//
a 632 609 751 454 480 827 765 814 412 877 377 436 363 934 374 942 977 318 987 327 981 873 922 377 468 919 391 266 1042 293 1015 314 1046 289 415 922 981 371 380 915 926 559 636 606
c 125 130 107 85 100 76 82 97 87 68 83 72 68 66 68 58 69 61 51 60 52 78 65 59 55 53 63 53 46 63 46 55 45 35 66 58 65 77 82 56 72 97 107 126
g 109 91 94 105 88 86 81 86 80 87 68 74 48 79 54 65 48 54 57 52 62 44 53 59 54 59 55 52 52 31 67 38 47 58 61 52 52 71 72 78 69 192 112 113
t 562 598 476 784 760 439 500 431 849 396 900 846 949 349 932 363 334 995 333 989 333 433 388 933 851 397 919 1057 288 1041 300 1021 290 1046 886 396 330 909 894 379 361 580 573 583
//
a 460 440 596 438 326 719 817 255 834 268 811 251 822 729 335 735 753 275 308 735 717 264 335 250 743 278 761 276 288 744 310 754 676 705 341 688 366 370 311 694 705 329 687 447 441 463
c 99 116 75 90 59 52 42 49 32 50 41 38 51 35 35 35 38 51 35 41 44 35 21 51 42 35 35 39 44 35 44 34 60 46 63 55 62 55 71 62 67 60 41 132 100 95
g 99 84 79 141 43 45 43 23 35 41 38 23 33 44 27 46 47 53 50 53 59 46 49 48 42 42 54 52 49 56 45 42 41 55 48 69 64 59 60 63 41 60 61 100 101 98
t 458 476 366 447 688 300 214 789 215 757 226 804 210 308 719 300 278 737 723 287 296 771 711 767 289 761 266 749 735 281 717 286 339 310 664 304 624 632 674 297 303 667 327 437 474 460
//
a 320 269 830 0 0 830 830 0 278 371
c 119 180 0 830 0 0 0 0 77 90
g 82 115 0 0 0 0 0 0 88 87
t 309 266 0 0 830 0 0 830 387 282
//
a 658 786 821 1013 921 1014 516 1089 462 537 424 1144 397 1121 418 461 1087 529 1096 1077 1104 505 1153 1294 393 1269 410 1252 388 1230 1128 516 413 1109 1117 539 469 593 1031 1098 545 1096 1030 943 751 766
c 158 121 161 102 116 83 119 74 92 68 66 68 67 61 66 82 60 56 72 76 62 74 65 46 62 48 72 46 67 55 63 78 80 80 81 72 70 79 88 77 88 83 100 100 139 149
g 141 134 108 87 94 93 67 74 69 60 51 60 69 80 61 85 73 76 65 66 76 59 71 65 52 67 47 67 46 64 69 71 57 82 74 87 77 97 85 86 91 94 94 123 159 157
t 771 687 638 526 597 538 1026 491 1105 1063 1187 456 1195 466 1183 1100 508 1067 495 509 486 1090 439 323 1221 344 1199 363 1227 379 468 1063 1178 457 456 1030 1112 959 524 467 1004 455 504 562 679 656
//
a 365 374 960 0 960 960 0 960 374 391
c 158 188 0 960 0 0 0 0 121 116
g 103 86 0 0 0 0 0 0 96 97
t 334 312 0 0 0 0 960 0 369 356
//
a 141 115 0 410 0 0 0 410 120 145
c 62 102 0 0 0 410 0 0 73 62
g 62 73 0 0 410 0 0 0 102 62
t 145 120 410 0 0 0 410 0 115 141
//
a 460 458 642 314 653 658 296 321 286 656 299 683 627 717 282 729 293 272 733 248 720 256 309 252 709 683 320 289 740 727 304 718 806 195 800 240 814 233 781 686 336 452 489 427
c 101 101 59 61 57 50 57 42 61 73 64 44 61 48 43 34 48 58 41 42 40 38 26 45 62 61 40 47 44 50 43 30 42 39 32 35 43 32 30 45 32 76 79 104
g 92 96 67 44 55 69 52 64 42 68 48 49 48 47 45 47 39 48 39 32 48 48 69 42 41 41 40 46 46 25 27 43 37 30 40 29 41 45 57 69 55 117 107 102
t 435 433 320 669 323 311 683 661 699 291 677 312 352 276 718 278 708 710 275 766 280 746 684 749 276 303 688 706 258 286 714 297 203 824 216 784 190 778 220 288 665 443 413 455
//
a 63 49 175 0 0 0 175 0 69 61
c 19 40 0 175 0 0 0 0 19 21
g 52 13 0 0 175 0 0 0 43 21
t 41 73 0 0 0 175 0 175 44 72
//
; Host name rsat
; Job started 2025-07-23.083458
; Job done 2025-07-23.083458
; Seconds 0.14
; user 0.14
; system 0.01
; cuser 0
; csystem 0