; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/09/17/oligo-analysis_2025-09-17.112154_z0MEBU_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/09/17/oligo-analysis_2025-09-17.112154_z0MEBU_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/09/17/oligo-analysis_2025-09-17.112154_z0MEBU_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/09/17/oligo-analysis_2025-09-17.112154_z0MEBU_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
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g 134 196 39 16 813 746 20 799 40 161 229
t 237 278 58 30 32 52 79 29 32 253 259
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g 312 416 171 179 410 126 22 1487 33 29 1515 19 41 545 290
t 558 497 1048 272 188 115 53 75 28 48 65 41 43 353 350
//
a 300 324 898 97 106 68 38 48 50 32 55 75 149 166 329 311
c 225 273 56 71 857 32 42 951 39 45 934 43 573 225 197 209
g 216 177 35 750 47 24 29 39 26 28 52 35 105 406 173 165
t 401 368 153 224 132 1018 1033 104 1027 1037 101 989 315 345 443 457
//
a 744 680 224 139 2162 107 51 117 212 922 741
c 342 391 84 76 56 39 38 2015 1898 370 511
g 439 416 1894 2106 59 39 30 65 106 353 377
t 891 929 214 95 139 2231 2297 219 200 771 787
//
a 2256 2389 5523 542 5749 5805 5627 787 721 2546 2517
c 1054 1043 131 273 106 63 101 4581 4599 1012 906
g 1103 1146 139 4895 78 117 144 269 214 871 910
t 1659 1494 279 362 139 87 200 435 538 1643 1739
//
a 368 376 744 0 744 0 744 0 344 304
c 106 110 0 744 0 0 0 0 112 126
g 105 135 0 0 0 744 0 744 140 128
t 165 123 0 0 0 0 0 0 148 186
//
a 363 346 239 104 35 32 46 24 44 50 35 76 253 340 301
c 316 300 355 995 24 1341 36 47 1336 47 49 1242 180 295 459
g 206 214 116 63 25 39 30 44 45 30 18 60 500 176 208
t 674 699 849 397 1475 147 1447 1444 134 1432 1457 181 626 748 591
//
a 792 776 0 2105 2105 2105 2105 0 831 810
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//
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//
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a 862 871 2289 135 2358 222 228 81 184 938 849
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//
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//
a 223 189 32 20 57 32 24 19 38 201 164
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