; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/11/13/dyad-analysis_2025-11-13.022516_GPbGxU_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2025/11/13/dyad-analysis_2025-11-13.022516_GPbGxU_pssm_count_matrices.txt ; Input files ; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/11/13/dyad-analysis_2025-11-13.022516_GPbGxU_pssm_count_matrices.tf ; Input format transfac ; Output files ; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2025/11/13/dyad-analysis_2025-11-13.022516_GPbGxU_pssm_count_matrices.txt ; Output format tab ; pseudo-weight 1 a 3857 3584 5925 6058 2473 6277 6277 2826 6315 6308 2531 6317 6255 5520 6228 5981 2580 5901 5802 3681 3808 c 646 581 178 141 276 108 95 203 88 88 188 127 109 107 134 180 327 230 210 566 698 g 1112 1654 475 422 3671 350 342 3544 384 344 3863 389 446 1177 449 475 3521 506 532 1594 1200 t 1414 1210 451 408 609 294 315 456 242 289 447 196 219 225 218 393 601 392 485 1188 1323 // a 22575 24136 5685 53693 4116 3117 3008 4035 52980 25812 25522 c 8201 8479 2095 2527 1195 930 1161 1833 2469 7583 7529 g 7194 6527 1556 1837 1588 1106 1254 2276 3051 8515 7326 t 28173 27001 56807 8086 59244 60990 60720 57999 7643 24233 25766 // a 1493 2316 519 3636 592 3699 489 3667 613 3647 590 3601 2772 2252 1524 c 220 242 96 48 64 26 75 37 56 18 96 57 94 279 360 g 1447 654 3154 155 3183 124 3283 152 3184 167 3141 190 905 767 1350 t 831 779 222 152 152 142 144 135 138 159 164 143 220 693 757 // a 3370 3501 642 8773 327 239 131 170 947 980 1063 3112 3083 c 1147 1280 226 214 116 77 50 65 495 317 369 1196 1322 g 1171 1023 243 283 120 101 88 193 7063 548 323 1353 1347 t 4309 4193 8886 727 9434 9580 9728 9569 1492 8152 8242 4336 4245 // a 2307 2937 4055 4812 923 4853 1096 4853 1061 4875 927 4835 4072 2906 2263 c 461 459 96 83 111 39 96 35 91 45 121 72 98 364 477 g 1464 1053 896 189 3964 179 3833 216 3921 166 4019 190 853 1001 1428 t 1037 820 222 185 271 198 244 165 196 183 202 172 246 998 1101 // a 2631 3041 2219 1912 4999 5015 1595 5074 5018 4344 5087 5005 1655 5100 5058 1812 5050 4803 2658 3082 c 373 369 237 228 97 97 201 116 115 89 85 93 206 112 96 221 125 159 437 537 g 1426 975 2548 3121 373 336 3611 358 411 1107 376 322 3508 303 290 3313 307 420 1580 1001 t 1311 1356 737 480 272 293 334 193 197 201 193 321 372 226 297 395 259 359 1066 1121 // a 12146 4758 19894 0 19894 0 19894 0 11893 4476 c 1543 1954 0 0 0 0 0 0 1289 1729 g 1729 1289 0 0 0 0 0 0 1954 1543 t 4476 11893 0 19894 0 19894 0 19894 4758 12146 // a 3190 3101 7771 0 0 0 0 7771 3197 2920 c 945 1171 0 0 0 0 0 0 902 990 g 1135 1223 0 0 0 0 7771 0 1190 1190 t 2501 2276 0 7771 7771 7771 0 0 2482 2671 // a 4365 4843 0 11854 11854 11854 0 11854 4680 4968 c 1445 1325 0 0 0 0 0 0 1181 1163 g 1202 1649 0 0 0 0 0 0 1333 1308 t 4842 4037 11854 0 0 0 11854 0 4660 4415 // a 684 991 714 616 1317 1455 401 1483 1339 582 1366 1533 360 1524 1277 1269 641 1479 405 1468 597 1271 647 1377 444 997 784 c 97 90 96 71 41 33 36 23 20 37 18 24 33 24 26 18 46 25 40 29 47 26 66 33 77 111 113 g 593 299 656 869 243 116 1166 125 278 1016 254 84 1250 116 342 359 951 114 1173 119 943 314 874 160 1025 333 504 t 328 322 236 146 101 98 99 71 65 67 64 61 59 38 57 56 64 84 84 86 115 91 115 132 156 261 301 // a 1356 1339 0 0 0 0 0 3760 1477 1372 c 292 318 0 0 0 0 0 0 371 472 g 706 669 3760 0 0 0 3760 0 689 625 t 1406 1434 0 3760 3760 3760 0 0 1223 1291 // a 10169 4580 17570 0 17570 3757 11532 0 17570 0 10082 4431 c 1537 1726 0 0 0 1171 1110 0 0 0 1182 1433 g 1433 1182 0 0 0 1110 1171 0 0 0 1726 1537 t 4431 10082 0 17570 0 11532 3757 17570 0 17570 4580 10169 // a 4572 10395 0 17486 0 11011 3710 17486 0 17486 4247 10179 c 1476 1420 0 0 0 1317 1448 0 0 0 1424 1259 g 1259 1424 0 0 0 1448 1317 0 0 0 1420 1476 t 10179 4247 17486 0 17486 3710 11011 0 17486 0 10395 4572 // a 1148 1043 388 332 498 324 243 224 217 366 302 207 339 260 210 406 346 292 524 750 1297 1290 c 1275 1092 458 762 2666 433 871 427 397 3219 362 320 3247 362 380 3216 361 335 2948 2364 962 1331 g 484 414 178 178 307 147 113 137 127 176 81 89 165 82 75 171 113 147 254 265 351 394 t 2665 3023 4548 4300 2101 4668 4345 4784 4831 1811 4827 4956 1821 4868 4907 1779 4752 4798 1846 2193 2962 2557 // ; Host name rsat ; Job started 2025-11-13.022653 ; Job done 2025-11-13.022653 ; Seconds 0.14 ; user 0.14 ; system 0.02 ; cuser 0 ; csystem 0