AC  assembly_1
XX
ID  tccaggacctgccagg
XX
DE  nnTCCAGGACCTGCCAGGnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      0.00      0.00      4.90
4         0.00      9.31      0.00      0.00
5         0.00     24.79      0.00      0.00
6        37.62      0.00      0.00      0.00
7         0.00      0.00     37.62      0.00
8         0.00      0.00     37.62      0.00
9        37.62      0.00      0.00      0.00
10        0.00     37.62      0.00      0.00
11        0.00     37.62      0.00      0.00
12        0.00      0.00      0.00     26.55
13        0.00      0.00      6.92      0.00
14        0.00      4.84      0.00      0.00
15        0.00      4.84      0.00      0.00
16        4.84      0.00      0.00      0.00
17        0.00      0.00      4.84      0.00
18        0.00      0.00      4.84      0.00
19        0.00      0.00      0.00      0.00
20        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 1
CC  id: assembly_1
CC  name: tccaggacctgccagg
CC  asmb.seed: aggacc
CC  matrix.nb: 1
CC  sites: 11
CC  consensus.strict: --TCCAGGACCTGCCAGG--
CC  consensus.strict.rc: --CCTGGCAGGTCCTGGA--
CC  consensus.IUPAC: nnTCCAGGACCTGCCAGGnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNCCTGGCAGGTCCTGGANN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]TCCAGGACCTGCCAGG[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]CCTGGCAGGTCCTGGA[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_2
XX
ID  agcaggtcctggcagggcc
XX
DE  nnAGCAGGTCCTGGCAGGGCCnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         1.57      0.00      0.00      0.00
4         0.00      0.00      1.67      0.00
5         0.00      6.92      0.00      0.00
6        26.55      0.00      0.00      0.00
7         0.00      0.00     37.62      0.00
8         0.00      0.00     37.62      0.00
9         0.00      0.00      0.00     37.62
10        0.00     37.62      0.00      0.00
11        0.00     37.62      0.00      0.00
12        0.00      0.00      0.00     37.62
13        0.00      0.00     24.79      0.00
14        0.00      0.00      9.31      0.00
15        0.00      4.84      0.00      0.00
16        5.33      0.00      0.00      0.00
17        0.00      0.00      5.33      0.00
18        0.00      0.00      5.33      0.00
19        0.00      0.00      5.33      0.00
20        0.00      5.33      0.00      0.00
21        0.00      5.33      0.00      0.00
22        0.00      0.00      0.00      0.00
23        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 2
CC  id: assembly_2
CC  name: agcaggtcctggcagggcc
CC  asmb.seed: agggcc
CC  matrix.nb: 2
CC  sites: 14
CC  consensus.strict: --AGCAGGTCCTGGCAGGGCC--
CC  consensus.strict.rc: --GGCCCTGCCAGGACCTGCT--
CC  consensus.IUPAC: nnAGCAGGTCCTGGCAGGGCCnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNGGCCCTGCCAGGACCTGCTNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]AGCAGGTCCTGGCAGGGCC[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]GGCCCTGCCAGGACCTGCT[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_3
XX
ID  ccccgcccc
XX
DE  nncCCCGCCCcnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      1.03      0.00      0.00
4         0.00      3.02      0.00      0.00
5         0.00      3.08      0.00      0.00
6         0.00      3.08      0.00      0.00
7         0.00      0.00      3.08      0.00
8         0.00      3.08      0.00      0.00
9         0.00      3.08      0.00      0.00
10        0.00      3.08      0.00      0.00
11        0.00      0.06      0.00      0.00
12        0.00      0.00      0.00      0.00
13        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 3
CC  id: assembly_3
CC  name: ccccgcccc
CC  asmb.seed: ccgccc
CC  matrix.nb: 3
CC  sites: 4
CC  consensus.strict: --cCCCGCCCc--
CC  consensus.strict.rc: --GGGGCGGGG--
CC  consensus.IUPAC: nncCCCGCCCcnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNGGGGCGGGGNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]cCCCGCCCc[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]GGGGCGGGG[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_4
XX
ID  cttcca
XX
DE  nnCTTCCAnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      2.69      0.00      0.00
4         0.00      0.00      0.00      2.69
5         0.00      0.00      0.00      2.69
6         0.00      2.69      0.00      0.00
7         0.00      2.69      0.00      0.00
8         2.69      0.00      0.00      0.00
9         0.00      0.00      0.00      0.00
10        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 4
CC  id: assembly_4
CC  name: cttcca
CC  asmb.seed: cttcca
CC  matrix.nb: 4
CC  sites: 1
CC  consensus.strict: --CTTCCA--
CC  consensus.strict.rc: --TGGAAG--
CC  consensus.IUPAC: nnCTTCCAnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNTGGAAGNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]CTTCCA[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]TGGAAG[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_5
XX
ID  ggtcctggcaggacctgcca
XX
DE  nnGGTCCTGGCAGGACCTGCCAnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      0.00     37.62      0.00
4         0.00      0.00     37.62      0.00
5         0.00      0.00      0.00     37.62
6         0.00     37.62      0.00      0.00
7         0.00     37.62      0.00      0.00
8         0.00      0.00      0.00     37.62
9         0.00      0.00     24.79      0.00
10        0.00      0.00      9.31      0.00
11        0.00     24.79      0.00      0.00
12       37.62      0.00      0.00      0.00
13        0.00      0.00     37.62      0.00
14        0.00      0.00     37.62      0.00
15       37.62      0.00      0.00      0.00
16        0.00     37.62      0.00      0.00
17        0.00     37.62      0.00      0.00
18        0.00      0.00      0.00     26.55
19        0.00      0.00      6.92      0.00
20        0.00      2.83      0.00      0.00
21        0.00      2.83      0.00      0.00
22        2.83      0.00      0.00      0.00
23        0.00      0.00      0.00      0.00
24        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 5
CC  id: assembly_5
CC  name: ggtcctggcaggacctgcca
CC  asmb.seed: gcagga
CC  matrix.nb: 5
CC  sites: 15
CC  consensus.strict: --GGTCCTGGCAGGACCTGCCA--
CC  consensus.strict.rc: --TGGCAGGTCCTGCCAGGACC--
CC  consensus.IUPAC: nnGGTCCTGGCAGGACCTGCCAnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNTGGCAGGTCCTGCCAGGACCNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]GGTCCTGGCAGGACCTGCCA[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]TGGCAGGTCCTGCCAGGACC[ACGT][ACGT]
XX
//
