; convert-matrix  -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/01/22/peak-motifs.2026-01-22.160303_2026-01-22.160303_u5bAOc/results/oligos_6nt_test_vs_ctrl/peak-motifs_oligos-2str-noov_6nt_test_vs_ctrl_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -return sites -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/01/22/peak-motifs.2026-01-22.160303_2026-01-22.160303_u5bAOc/results/oligos_6nt_test_vs_ctrl/peak-motifs_oligos-2str-noov_6nt_test_vs_ctrl_pssm_count_matrices.txt
; Input files
;	input	/var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/01/22/peak-motifs.2026-01-22.160303_2026-01-22.160303_u5bAOc/results/oligos_6nt_test_vs_ctrl/peak-motifs_oligos-2str-noov_6nt_test_vs_ctrl_pssm_count_matrices.tf
; Input format        	transfac
; Output files
;	output	/var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/01/22/peak-motifs.2026-01-22.160303_2026-01-22.160303_u5bAOc/results/oligos_6nt_test_vs_ctrl/peak-motifs_oligos-2str-noov_6nt_test_vs_ctrl_pssm_count_matrices.txt
; Output format       	tab
; pseudo-weight       	1
a	25	25	59	5	7	2	5	71	4	72	70	29	25
c	13	16	4	3	4	0	4	1	1	0	2	14	14
g	17	14	4	4	5	0	63	1	1	3	1	13	18
t	22	22	10	65	61	75	5	4	71	2	4	21	20
//
; Sites	77
>site_0
GGGTGTGATAACA
>site_1
GTTTCTGATAACC
>site_2
TAATTTAATAAAA
>site_3
GCAATTGATAATG
>site_4
TATTATGATAAAG
>site_5
CGATTTGAAAAGA
>site_6
TCCTTTGATAACA
>site_7
GAATTTGATGAGA
>site_8
AGATTTGATAAAC
>site_9
ATATTTTATAAGG
>site_10
AGATTTGATGAGG
>site_11
GTAGGTGATAAGA
>site_12
AAATCTGATAAAG
>site_13
TAGTTTGATACAT
>site_14
GAAATTGATAAGA
>site_15
TCATTTGATATTG
>site_16
CGATTTCATAAAC
>site_17
TAATATGATAAAT
>site_18
CGATATGATAAAT
>site_19
GAAGTTGATAAAG
>site_20
GCATTTGTTAATG
>site_21
GAATTTGATATGA
>site_22
AAATGTGATAAAA
>site_23
CCCTCTGATAACA
>site_24
ATAGTTGATAATT
>site_25
AAATTTAATAATC
>site_26
GTATTTGATAATG
>site_27
ATTTTTGATAAAT
>site_28
CGATTTGCTAAAA
>site_29
TGATTTGATATTG
>site_30
TTATTTGAAAAAT
>site_31
AAACTTGATAATA
>site_32
ACATTTGATGAAG
>site_33
GAGTTTGATACTG
>site_34
TAATTTGTTAAAA
>site_35
ATATTTGTTAAAT
>site_36
TTATATGATAAAG
>site_37
ATATTTTATAAGG
>site_38
AGATTTGATAAAC
>site_39
TAATTTGATAGGC
>site_40
TTATTTAATAATT
>site_41
CCATTTGAAAAAA
>site_42
TTATTTGATAATT
>site_43
AAATTTGATTAAA
>site_44
CTTTATGATAACG
>site_45
TCATTTTATAACG
>site_46
ATATTTGTTAACC
>site_47
GAATTTCATAAGA
>site_48
TATTTTGATAAGA
>site_49
AAATTTCATAACT
>site_50
CAAATTGATAAGC
>site_51
CGATTTGGTAATG
>site_52
CAGTATGATAAAT
>site_53
TTATTTTATAATT
>site_54
AGTTATGATAAAT
>site_55
GATTTTGATAATC
>site_56
ATATTTGATTATC
>site_57
TTATTTGAGAACA
>site_58
GCTATTGATAACG
>site_59
TCATTAGATAATA
>site_60
AGACTTGATAATA
>site_61
ACATTAGATAAAA
>site_62
AAACTTGATAACC
>site_63
ATATTTAATAAAA
>site_64
ATTTTTGATAAAT
>site_65
CCTATTGATAATC
>site_66
GGATTTAATAAAA
>site_67
GGATTTGAAAAAT
>site_68
TCATTTGATAACT
>site_69
GCAGTTGATAATA
>site_70
TTATTTGATATTT
>site_71
ACCTGTGATAAGT
>site_72
AAATTTGACAAAT
>site_73
CTATTTTATAAAC
>site_74
TCATCTGATAACT
>site_75
CACTGTGATAACC
>site_76
TTATTTCATAATA
a	84	84	12	11	199	206	22	30	221	217	73	81
c	31	33	3	2	7	8	4	4	6	8	50	46
g	46	50	8	5	4	4	8	6	2	3	33	31
t	79	73	217	222	30	22	206	200	11	12	84	82
//
; Sites	240
>site_0
AATTTATTAAAA
>site_1
TTTTAATAAATT
>site_2
TATTAATTATAT
>site_3
ATATAATTAATA
>site_4
CCTTAATAAAAA
>site_5
TTTTTATTAAGG
>site_6
TGTTAATTTATG
>site_7
CATAAATTAACA
>site_8
TTTTTATTAAAT
>site_9
ATTTAATAAAAA
>site_10
AAGTAATTAAAA
>site_11
TTTTAATTACTT
>site_12
AATAAATTAAAA
>site_13
TTTTAATTTATT
>site_14
ATTTAAATAATA
>site_15
TATTATTTAAAT
>site_16
TTTTAAATAAAT
>site_17
ATTTATTTAAAA
>site_18
AGATAATTAACA
>site_19
TGTTAATTATCT
>site_20
TATTTATTAATA
>site_21
TATTAATAAATA
>site_22
TTTTAAATAAAT
>site_23
ATTTATTTAAAA
>site_24
TGTTAATTATAT
>site_25
ATATAATTAACA
>site_26
TATTAATAAAGA
>site_27
TCTTTATTAATA
>site_28
TGTTATTTAAAT
>site_29
ATTTAAATAACA
>site_30
ATTTAAATAACT
>site_31
AGTTATTTAAAT
>site_32
GATTAAATAAAT
>site_33
ATTTATTTAATC
>site_34
TATTACTTAACG
>site_35
CGTTAAGTAATA
>site_36
TATTTATTAACT
>site_37
AGTTAATAAATA
>site_38
GCTTTATTAAGA
>site_39
TCTTAATAAAGC
>site_40
GCTTATTTAATC
>site_41
GATTAAATAAGC
>site_42
GCTTTATTAACG
>site_43
CGTTAATAAAGC
>site_44
GCTTAATGAATG
>site_45
CATTCATTAAGC
>site_46
GGTTGATTAAAT
>site_47
ATTTAATCAACC
>site_48
TGTTAATAAAAT
>site_49
ATTTTATTAACA
>site_50
CATTAATTAATG
>site_51
CATTAATTAATG
>site_52
GATTTATTAATG
>site_53
CATTAATAAATC
>site_54
TGTTAAATAATT
>site_55
AATTATTTAACA
>site_56
TGTTAATTAATA
>site_57
TATTAATTAACA
>site_58
ATTTTATTAATT
>site_59
AATTAATAAAAT
>site_60
TATTAACTAATG
>site_61
CATTAGTTAATA
>site_62
AGTTATTTAATG
>site_63
CATTAAATAACT
>site_64
ATTTTATTAAAG
>site_65
CTTTAATAAAAT
>site_66
AGTTACTTAAAA
>site_67
TTTTAAGTAACT
>site_68
TATTAAATAATA
>site_69
TATTATTTAATA
>site_70
GTTTAAGTAAGT
>site_71
ACTTACTTAAAC
>site_72
TGTTATTTAACG
>site_73
CGTTAAATAACA
>site_74
TTTTAAGTAAGC
>site_75
GCTTACTTAAAA
>site_76
TTTTAATTAAAT
>site_77
ATTTAATTAAAA
>site_78
TTTTAAGTAAGA
>site_79
TCTTACTTAAAA
>site_80
GTTTAAATAATT
>site_81
AATTATTTAAAC
>site_82
TATAAATTAATT
>site_83
AATTAATTTATA
>site_84
AATTAATTAGTC
>site_85
GACTAATTAATT
>site_86
GGTTTATTAATT
>site_87
AATTAATAAACC
>site_88
GTTTGATTAATT
>site_89
AATTAATCAAAC
>site_90
GATTAATTATAA
>site_91
TTATAATTAATC
>site_92
CGTTTATTAATA
>site_93
TATTAATAAACG
>site_94
CTTAAATTAACA
>site_95
TGTTAATTTAAG
>site_96
AGATAATTAATA
>site_97
TATTAATTATCT
>site_98
GATTAATAAAAT
>site_99
ATTTTATTAATC
>site_100
AGTTTATTAAGT
>site_101
ACTTAATAAACT
>site_102
GATTAGTTAATC
>site_103
GATTAACTAATC
>site_104
TTTTAACTAACT
>site_105
AGTTAGTTAAAA
>site_106
ATTTAATTCAAA
>site_107
ATTTAATTTAAC
>site_108
GTTAAATTAAAT
>site_109
CGTTAAATAAGC
>site_110
GCTTATTTAACG
>site_111
TTGTAATTAAAG
>site_112
CTTTAATTACAA
>site_113
CATTAATTATGT
>site_114
ACATAATTAATG
>site_115
GCTTATTTAAAA
>site_116
TTTTAAATAAGC
>site_117
AGTGAATTAATT
>site_118
AATTAATTCACT
>site_119
AATTAATTGAGT
>site_120
ACTCAATTAATT
>site_121
AGCTAATTAAGT
>site_122
ACTTAATTAGCT
>site_123
GATTAATAAAAC
>site_124
GTTTTATTAATC
>site_125
CATTAATTACCA
>site_126
TGGTAATTAATG
>site_127
ACTGAATTAATC
>site_128
GATTAATTCAGT
>site_129
TATTAATGAATG
>site_130
CATTCATTAATA
>site_131
TGATAATTAAGT
>site_132
ACTTAATTATCA
>site_133
TTTTTATTAATC
>site_134
GATTAATAAAAA
>site_135
ATTTAAGTAACA
>site_136
TGTTACTTAAAT
>site_137
TCTTATTTAATA
>site_138
TATTAAATAAGA
>site_139
GGTTAAATAAAT
>site_140
ATTTATTTAACC
>site_141
CGTAAATTAAAC
>site_142
GTTTAATTTACG
>site_143
AATTTATTAATG
>site_144
CATTAATAAATT
>site_145
CTTTAAATAATT
>site_146
AATTATTTAAAG
>site_147
TGATAATTAAAT
>site_148
ATTTAATTATCA
>site_149
GATTAAGTAACA
>site_150
TGTTACTTAATC
>site_151
TCTTAATCAATT
>site_152
AATTGATTAAGA
>site_153
AATTAGTTAAAA
>site_154
TTTTAACTAATT
>site_155
GATTAATAAATT
>site_156
AATTTATTAATC
>site_157
GGATAATTAAAT
>site_158
ATTTAATTATCC
>site_159
AATTAATGAATT
>site_160
AATTCATTAATT
>site_161
CATTAATAAAAA
>site_162
TTTTTATTAATG
>site_163
GCTTAATAAAGA
>site_164
TCTTTATTAAGC
>site_165
TGTTAATTAATT
>site_166
AATTAATTAACA
>site_167
AATTAATTCAGA
>site_168
TCTGAATTAATT
>site_169
ATTAAATTAATA
>site_170
TATTAATTTAAT
>site_171
AATTAATAAAAA
>site_172
TTTTTATTAATT
>site_173
CGTTAATTTATC
>site_174
GATAAATTAACG
>site_175
TGTTAAGTAAAA
>site_176
TTTTACTTAACA
>site_177
GATTAATTATAC
>site_178
GTATAATTAATC
>site_179
CATTAAATAATA
>site_180
TATTATTTAATG
>site_181
ATTAAATTAATC
>site_182
GATTAATTTAAT
>site_183
GATTAATGAAAT
>site_184
ATTTCATTAATC
>site_185
GGTTAATTACAA
>site_186
TTGTAATTAACC
>site_187
ATTTAATTACGA
>site_188
TCGTAATTAAAT
>site_189
GCTTCATTAAAA
>site_190
TTTTAATGAAGC
>site_191
AATTATTTAAAA
>site_192
TTTTAAATAATT
>site_193
GTTTCATTAATT
>site_194
AATTAATGAAAC
>site_195
CATTAATTGATA
>site_196
TATCAATTAATG
>site_197
TGTTAAATAATA
>site_198
TATTATTTAACA
>site_199
TTTTTATTAAAT
>site_200
ATTTAATAAAAA
>site_201
ATTTCATTAAAA
>site_202
AGTTTATTAAGT
>site_203
ACTTAATAAACT
>site_204
TCTAAATTAATC
>site_205
GATTAATTTAGA
>site_206
ACATAATTAAAT
>site_207
ATTTAATTATGT
>site_208
TGTTAATAAACC
>site_209
GGTTTATTAACA
>site_210
GATTAAATAAAA
>site_211
TTTTATTTAATC
>site_212
TTTTTATTAAAT
>site_213
ATTTAATAAAAA
>site_214
AGTTTATTAACC
>site_215
GGTTAATAAACT
>site_216
ACTGAATTAATT
>site_217
AATTAATTCAGT
>site_218
AATTAATTACAA
>site_219
TTGTAATTAATT
>site_220
TATTAATTTACT
>site_221
AGTAAATTAATA
>site_222
ACTTAATTACAT
>site_223
ATGTAATTAAGT
>site_224
AGTTTATTAAGT
>site_225
ACTTAATAAACT
>site_226
GATTAATTAGAA
>site_227
TTCTAATTAATC
>site_228
CATTATTTAACA
>site_229
TGTTAAATAATG
>site_230
CGTTGATTAAAA
>site_231
TTTTAATCAACG
>site_232
AGTTTATTAAAC
>site_233
GTTTAATAAACT
>site_234
TGTGAATTAAGC
>site_235
GCTTAATTCACA
>site_236
CATTAATTATGT
>site_237
ACATAATTAATG
>site_238
CAGTAATTAAAG
>site_239
CTTTAATTACTG
a	13	13	4	7	4	52	51	3	54	0	51	21	18
c	14	9	50	3	3	0	1	4	0	1	1	10	18
g	18	20	3	0	50	4	3	3	3	0	5	11	6
t	13	16	1	48	1	2	3	48	1	57	1	16	16
//
; Sites	58
>site_0
TGCTGATTATACT
>site_1
AACAGAATATACT
>site_2
TGCCGAATATAAA
>site_3
GTCTGAATATGAA
>site_4
CTCTGAAAATAGC
>site_5
TTCTCAATATATT
>site_6
AGCTGAAGATATC
>site_7
ACCTGAATGTAGT
>site_8
CGCTGAAGATAAC
>site_9
GACTGTGTATACC
>site_10
CGCTGAATATATC
>site_11
TACTGAGTATTAC
>site_12
TCCAGAATATAAA
>site_13
CAGTGAATATAAA
>site_14
TGCTAAATATATA
>site_15
CGCTAAATATATC
>site_16
TACTGAATGTATA
>site_17
GGCAGAATATAGC
>site_18
GGCAGAATATAGA
>site_19
GGCAGAATATAGA
>site_20
AGCTGAATATGTC
>site_21
CTATGAATATAAA
>site_22
AAATGAATATAAA
>site_23
TCCTGAATGTATC
>site_24
AGCTGAACATAAC
>site_25
AGCTCAATATATT
>site_26
AAGTGAATATAAT
>site_27
ATCTGAACATAGG
>site_28
CCCTGAATATGGC
>site_29
CCCTGGATATAAG
>site_30
ACCTGATTATACA
>site_31
CGCTTAATATATT
>site_32
TGATGAATATATT
>site_33
TTGTGAATATAAA
>site_34
CCCTGACTATAAC
>site_35
TACTGAATTTACT
>site_36
GGCTGGATATAAA
>site_37
AGCTGAAAATAAA
>site_38
GTTTGAATATAAT
>site_39
TACAGAATATAAG
>site_40
GTCTGATTATATT
>site_41
GTCAGAATATACC
>site_42
AACTAAATATAAG
>site_43
GACTGGATATAGC
>site_44
GTCTGAATATGGG
>site_45
GGCCGAATATACG
>site_46
GTCTGAATACAGT
>site_47
GGATGAATATAAC
>site_48
GGCTGAAGATAAA
>site_49
CTCTGAAAATATC
>site_50
CCCTAAATATAGT
>site_51
GTCCGAGTATATA
>site_52
TACTCTATATAAC
>site_53
GTCTGAATATCCA
>site_54
GTCTGAACATATT
>site_55
CCCTGAACATATT
>site_56
CACTGAATATGCT
>site_57
ATCTGGATATACA
a	2	1	0	0	0	2	2	0	1	0	0	0	1	0	2	2	1	0	1	1	1	0	0
c	0	0	2	0	0	0	0	1	0	0	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0	0	1	0
g	0	1	0	0	2	0	0	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	1	0	0	1	0	1
t	0	0	0	2	0	0	0	1	0	2	0	2	0	1	0	0	1	1	1	1	0	1	1
//
; Sites	2
>site_0
AGCTGAATATGTCTAAAGTTGTT
>site_1
AACTGAACGTGTACAATTAAACG
a	5	6	2	18	3	3	2	2	20	23	24	1	3	0	1	15	13
c	5	5	2	2	0	3	2	1	1	1	0	4	0	2	3	1	4
g	7	9	1	4	3	0	22	0	3	3	1	1	23	1	3	5	3
t	11	8	23	4	22	22	2	25	4	1	3	22	2	25	21	7	8
//
; Sites	28
>site_0
CCTATTGTGAATATTTA
>site_1
GATATTGAAATTGTCTA
>site_2
ACTGTAGTAAATGTTTC
>site_3
TTTTTTGTTAACGTTAC
>site_4
ATTATTCTCAATGTGAA
>site_5
TCTGTAGTAGATGTTTT
>site_6
CATGTTGTAGATGTCGT
>site_7
GATATTGTAAGTGTTAA
>site_8
GTAATTGTAAAGGTTTA
>site_9
TGTATTTTTAATGTTGC
>site_10
TTTATTGTAAATTTCTT
>site_11
TCTAACGTTAATGTTAC
>site_12
TGTATTGAGAATGTTAA
>site_13
TATTATGTAAATGCTAT
>site_14
AGTATCCTAATTGTTAT
>site_15
GTCATTGTTTATGTTAA
>site_16
GGTTGTGTAATTGTTAA
>site_17
GGTATAGCAAAAGTTAA
>site_18
CATATTTTAAATATTGA
>site_19
TTTCGTGTAAATGCTGT
>site_20
TCTATTGTAGATTTGTG
>site_21
GGGCTTGTAAATGGTAA
>site_22
AATAGTGTAAACGTGAT
>site_23
TGTATTGTGAACGTAAT
>site_24
CGTGACGTAAATGTTAA
>site_25
TTAATTGTACACGTTCA
>site_26
CTCATTATAAATATTAG
>site_27
AGTTTTATAAATGTTGG
; Host name	rsat
; Job started	2026-01-22.160323
; Job done	2026-01-22.160323
; Seconds	0.12
;	user	0.12
;	system	0
;	cuser	0
;	csystem	0
