AC  assembly_1
XX
ID  ccactgca
XX
DE  nnCCACTGCann
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      1.40      0.00      0.00
4         0.00      1.40      0.00      0.00
5         1.40      0.00      0.00      0.00
6         0.00      1.40      0.00      0.00
7         0.00      0.00      0.00      1.40
8         0.00      0.00      1.40      0.00
9         0.00      1.40      0.00      0.00
10        0.20      0.00      0.00      0.00
11        0.00      0.00      0.00      0.00
12        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 1
CC  id: assembly_1
CC  name: ccactgca
CC  asmb.seed: ccactgc
CC  matrix.nb: 1
CC  sites: 2
CC  consensus.strict: --CCACTGCa--
CC  consensus.strict.rc: --TGCAGTGG--
CC  consensus.IUPAC: nnCCACTGCann
CC  consensus.IUPAC.rc: NNTGCAGTGGNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]CCACTGCa[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]TGCAGTGG[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_2
XX
ID  aatgtat
XX
DE  nnaatgtatnn
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.21      0.00      0.00      0.00
4         0.21      0.00      0.00      0.00
5         0.00      0.00      0.00      0.21
6         0.00      0.00      0.21      0.00
7         0.00      0.00      0.00      0.21
8         0.21      0.00      0.00      0.00
9         0.00      0.00      0.00      0.21
10        0.00      0.00      0.00      0.00
11        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 2
CC  id: assembly_2
CC  name: aatgtat
CC  asmb.seed: aatgtat
CC  matrix.nb: 2
CC  sites: 1
CC  consensus.strict: --aatgtat--
CC  consensus.strict.rc: --ATACATT--
CC  consensus.IUPAC: nnaatgtatnn
CC  consensus.IUPAC.rc: NNATACATTNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]aatgtat[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]ATACATT[ACGT][ACGT]
XX
//
AC  assembly_3
XX
ID  gagtgca
XX
DE  nngagtgcann
P0           a         c         g         t
1         0.00      0.00      0.00      0.00
2         0.00      0.00      0.00      0.00
3         0.00      0.00      0.03      0.00
4         0.03      0.00      0.00      0.00
5         0.00      0.00      0.03      0.00
6         0.00      0.00      0.00      0.03
7         0.00      0.00      0.03      0.00
8         0.00      0.03      0.00      0.00
9         0.03      0.00      0.00      0.00
10        0.00      0.00      0.00      0.00
11        0.00      0.00      0.00      0.00
XX
CC  program: pattern-assembly
CC  matrix.nb: 3
CC  id: assembly_3
CC  name: gagtgca
CC  asmb.seed: gagtgca
CC  matrix.nb: 3
CC  sites: 1
CC  consensus.strict: --gagtgca--
CC  consensus.strict.rc: --TGCACTC--
CC  consensus.IUPAC: nngagtgcann
CC  consensus.IUPAC.rc: NNTGCACTCNN
CC  consensus.regexp: [acgt][acgt]gagtgca[acgt][acgt]
CC  consensus.regexp.rc: [ACGT][ACGT]TGCACTC[ACGT][ACGT]
XX
//
