AC  HOXD1_1_rc_shift0
XX
ID  HOXD1_1_rc
XX
DE  oligos_6nt_mkv2_m2 versus HOXD1_1_rc; m=220/234; ncol2=17; w=-5; offset=-5; strand=R; shift=0; score=0.440743; wmcaryTAATTAryt
P0           a         c         g         t
1       295482    184238    200479    319800
2       318795    273286    173211    234708
3       240101    321759    217963    220176
4       664191    185358     83424     67027
5       276820    102300    576929     43951
6        40876    453601    210160    295364
7         9716    142801      1515    845968
8       921606     65097     12338       959
9       985759      3545      2777      7920
10        7920      2777      3545    985759
11         959     12338     65097    921606
12      845968      1515    142801      9716
13      295364    210160    453601     40876
14       51310    401477    145391    401822
15      238937    126086    226338    408638
XX
CC  shift: 
CC  consensus.strict: tacagcTAATTAgtt
CC  consensus.strict.rc: AACTAATTAGCTGTA
CC  consensus.IUPAC: wmcaryTAATTAryt
CC  consensus.IUPAC.rc: ARYTAATTARYTGKW
CC  consensus.regexp: [at][ac]ca[ag][ct]TAATTA[ag][ct]t
CC  consensus.regexp.rc: A[AG][CT]TAATTA[AG][CT]TG[GT][AT]
CC  description: oligos_6nt_mkv2_m2 versus HOXD1_1_rc; m=220/234; ncol2=17; w=-5; offset=-5; strand=R; shift=0; score=0.440743; wmcaryTAATTAryt
XX
//