; info-gibbs 20140213
; /var/www/html/rsat/bin/info-gibbs --strand=+- -i /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/04/30/retrieve-seq_2026-04-30.193218_GfGu1D.fasta.fasta -w 17 --mean_sps=1 --iter=1000 --nrun=5 --motifs=5
; title
; started at Thu Apr 30 19:38:14 2026
; random seed 1777570694
; number of runs 5
; number of iterations 1000
; sequences 26
; total size in bp 13086
; expected motif occurrences 26
; prior a:0.304|c:0.196|g:0.196|t:0.304
; motifs fo find 5
;
; motif 1.1
; avg.llr 200.516
; avg.ic 7.022
; log likelihood ratio 206.936
; information content 7.257
; motif width 17
; sites 26
; (seq and pos start at 1)
; seq strand pos site
; 24 - 23 ÖSsX
; 24 + 99 ÖSsX
; 5 - 122 ÖSsX
; 20 + 44 ÖSsX
; 3 - 378 ÖSsX
; 7 - 37 ÖSsX
; 4 - 187 ÖSsX
; 21 + 390 ÖSsX
; 25 + 1 ÖSsX
; 11 - 4 ÖSsX
; 1 - 8 ÖSsX
; 25 - 117 ÖSsX
; 3 + 86 ÖSsX
; 14 + 69 ÖSsX
; 3 - 272 ÖSsX
; 2 - 306 ÖSsX
; 22 + 208 ÖSsX
; 21 + 395 ÖSsX
; 20 - 129 ÖSsX
; 4 + 107 ÖSsX
; 14 - 296 ÖSsX
; 22 + 45 ÖSsX
; 20 + 374 ÖSsX
; 21 + 328 ÖSsX
; 17 + 24 ÖSsX
; 16 + 61 ÖSsX
A | 1 7 15 13 1 6 3 10 7 4 13 4 7 10 0 3 9
C | 1 19 7 1 0 7 9 11 3 3 1 21 12 15 5 2 10
G | 18 0 3 12 17 8 10 2 0 7 8 0 7 0 14 21 2
T | 6 0 1 0 8 5 4 3 16 12 4 1 0 1 7 0 5
//
; motif 1.2
; avg.llr 200.350
; avg.ic 7.007
; log likelihood ratio 212.417
; information content 7.408
; motif width 17
; sites 26
; (seq and pos start at 1)
; seq strand pos site
; 9 + 162 ÖSsX
; 3 + 283 ÖSsX
; 21 - 333 ÖSsX
; 18 - 264 ÖSsX
; 7 - 34 ÖSsX
; 20 + 287 ÖSsX
; 19 - 186 ÖSsX
; 9 - 191 ÖSsX
; 3 + 314 ÖSsX
; 9 - 347 ÖSsX
; 2 - 98 ÖSsX
; 5 + 55 ÖSsX
; 9 + 171 ÖSsX
; 23 + 86 ÖSsX
; 10 - 180 ÖSsX
; 20 + 458 ÖSsX
; 19 - 170 ÖSsX
; 15 - 103 ÖSsX
; 3 + 223 ÖSsX
; 3 + 325 ÖSsX
; 2 - 105 ÖSsX
; 5 + 49 ÖSsX
; 1 - 71 ÖSsX
; 3 + 228 ÖSsX
; 10 - 181 ÖSsX
; 3 + 217 ÖSsX
A | 15 24 17 2 19 18 14 21 18 12 8 18 20 23 8 15 14
C | 8 1 0 9 6 0 7 4 4 14 9 0 0 1 14 10 4
G | 1 0 0 5 0 1 0 0 2 0 0 0 2 0 2 1 4
T | 2 1 9 10 1 7 5 1 2 0 9 8 4 2 2 0 4
//
; motif 1.3
; avg.llr 207.682
; avg.ic 7.235
; log likelihood ratio 215.587
; information content 7.523
; motif width 17
; sites 26
; (seq and pos start at 1)
; seq strand pos site
; 12 + 140 ÖSsX
; 3 + 232 ÖSsX
; 16 + 96 ÖSsX
; 10 - 71 ÖSsX
; 22 - 227 ÖSsX
; 16 + 83 ÖSsX
; 8 + 23 ÖSsX
; 15 - 153 ÖSsX
; 21 + 19 ÖSsX
; 9 + 157 ÖSsX
; 20 - 174 ÖSsX
; 2 - 312 ÖSsX
; 26 + 9 ÖSsX
; 21 + 392 ÖSsX
; 21 + 17 ÖSsX
; 24 - 70 ÖSsX
; 9 - 374 ÖSsX
; 2 + 98 ÖSsX
; 19 - 219 ÖSsX
; 1 - 59 ÖSsX
; 11 + 69 ÖSsX
; 20 + 549 ÖSsX
; 21 + 15 ÖSsX
; 9 - 355 ÖSsX
; 22 - 218 ÖSsX
; 20 + 523 ÖSsX
A | 3 16 3 13 22 21 26 14 6 7 10 3 5 7 13 14 15
C | 16 9 4 3 2 5 0 7 2 16 7 23 5 10 7 6 5
G | 7 1 4 9 2 0 0 1 10 3 9 0 16 8 2 3 1
T | 0 0 15 1 0 0 0 4 8 0 0 0 0 1 4 3 5
//
; motif 1.4
; avg.llr 196.839
; avg.ic 6.900
; log likelihood ratio 200.192
; information content 7.043
; motif width 17
; sites 26
; (seq and pos start at 1)
; seq strand pos site
; 25 - 173 ÖSsX
; 20 + 273 ÖSsX
; 14 + 13 ÖSsX
; 25 - 95 ÖSsX
; 14 + 66 ÖSsX
; 14 - 79 ÖSsX
; 14 - 287 ÖSsX
; 11 - 188 ÖSsX
; 20 - 171 ÖSsX
; 11 + 65 ÖSsX
; 7 - 6 ÖSsX
; 3 + 184 ÖSsX
; 12 - 163 ÖSsX
; 6 - 16 ÖSsX
; 3 - 274 ÖSsX
; 14 - 262 ÖSsX
; 25 - 172 ÖSsX
; 22 - 1 ÖSsX
; 20 - 149 ÖSsX
; 8 - 34 ÖSsX
; 14 + 75 ÖSsX
; 14 - 305 ÖSsX
; 25 - 15 ÖSsX
; 25 + 22 ÖSsX
; 16 + 6 ÖSsX
; 12 + 134 ÖSsX
A | 3 18 3 1 9 2 1 10 15 12 12 18 12 7 4 4 4
C | 19 6 4 4 14 16 0 7 1 1 2 4 0 3 19 7 1
G | 0 0 10 17 3 4 18 7 6 3 12 1 14 13 2 15 14
T | 4 2 9 4 0 4 7 2 4 10 0 3 0 3 1 0 7
//
; motif 1.5
; avg.llr 213.842
; avg.ic 7.438
; log likelihood ratio 213.842
; information content 7.438
; motif width 17
; sites 26
; (seq and pos start at 1)
; seq strand pos site
; 15 + 95 ÖSsX
; 3 - 245 ÖSsX
; 3 - 228 ÖSsX
; 24 + 58 ÖSsX
; 15 + 146 ÖSsX
; 22 - 157 ÖSsX
; 20 - 101 ÖSsX
; 24 + 48 ÖSsX
; 21 - 451 ÖSsX
; 17 + 67 ÖSsX
; 25 + 55 ÖSsX
; 18 + 85 ÖSsX
; 10 + 238 ÖSsX
; 10 + 165 ÖSsX
; 2 + 221 ÖSsX
; 3 - 247 ÖSsX
; 14 + 172 ÖSsX
; 20 - 296 ÖSsX
; 21 + 172 ÖSsX
; 21 - 449 ÖSsX
; 16 - 68 ÖSsX
; 22 + 10 ÖSsX
; 24 + 54 ÖSsX
; 14 + 182 ÖSsX
; 24 - 95 ÖSsX
; 11 + 193 ÖSsX
A | 1 0 1 0 0 0 6 1 0 0 3 4 3 7 3 5 0
C | 2 0 1 7 1 4 0 8 6 10 1 0 0 4 1 3 9
G | 2 7 15 0 13 5 6 11 9 9 0 0 1 4 0 4 7
T | 21 19 9 19 12 17 14 6 11 7 22 22 22 11 22 14 10
//