/var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/05/11/matrix-clustering_2026-05-11.152629_LqheCB/matrix-clustering_tables/alignment_table.tab


id name cluster strand offset_up offset_down width aligned_consensus aligned_consensus_rc
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m14_KAISO_HUMAN.H11MO.0.A KAISO_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 0 0 15 sarrymtCGCGAGAr YTCTCGCGAKRYYTS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m74_KAISO_HUMAN.H11MO.0.A KAISO_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 0 0 15 sarrymtCGCGAGAr YTCTCGCGAKRYYTS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m15_KAISO_HUMAN.H11MO.1.A KAISO_HUMAN.H11MO.1.A cluster_1 D 4 0 15 ++++tmtCGCGAGAr YTCTCGCGAKA++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m75_KAISO_HUMAN.H11MO.1.A KAISO_HUMAN.H11MO.1.A cluster_1 D 4 0 15 ++++tmtCGCGAGAr YTCTCGCGAKA++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m16_KAISO_HUMAN.H11MO.2.A KAISO_HUMAN.H11MO.2.A cluster_2 D 2 1 15 ++yTsGCrrGArkw+ +WMYTCYYGCSAR++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m76_KAISO_HUMAN.H11MO.2.A KAISO_HUMAN.H11MO.2.A cluster_2 D 2 1 15 ++yTsGCrrGArkw+ +WMYTCYYGCSAR++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m4_E2F1_HUMAN.H11MO.0.A E2F1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_2 D 0 1 15 rgrgGGCGGGArrr+ +YYYTCCCGCCCYCY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m54_TFDP1_HUMAN.H11MO.0.C TFDP1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_2 D 0 1 15 rrrrGGCGGGAarr+ +YYTTCCCGCCYYYY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m6_E2F6_HUMAN.H11MO.0.A E2F6_HUMAN.H11MO.0.A cluster_2 D 2 0 15 ++rrGGCGGGArrrr YYYYTCCCGCCYY++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m7_E2F7_HUMAN.H11MO.0.B E2F7_HUMAN.H11MO.0.B cluster_2 D 2 0 15 ++grGGCGGGRaarr YYTTYCCCGCCYC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m5_E2F4_HUMAN.H11MO.0.A E2F4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_2 D 1 1 15 +HYTYCCCGCCCYS+ +srgGGCGGGRard+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m38_REST_HUMAN.H11MO.0.A REST_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 0 0 22 tTCAGcACCayGGACAGckcCm KGGMGCTGTCCRTGGTGCTGAA
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m73_REST_HUMAN.H11MO.0.A REST_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 0 0 22 tTCAGcACCayGGACAGckcCm KGGMGCTGTCCRTGGTGCTGAA
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m84_REST_m11_known_matrix REST_m11_known_matrix cluster_3 D 0 1 22 TTCAGCACCrCGGACAGmrsC+ +GSYKCTGTCCGYGGTGCTGAA
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m87_REST_m14_known_matrix REST_m14_known_matrix cluster_3 D 0 1 22 tTCAGcACCatGGACAGckcC+ +GGMGCTGTCCATGGTGCTGAA
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m85_REST_m12_known_matrix REST_m12_known_matrix cluster_3 D 0 1 22 GGYRCTSTCCGHGGWGCTRAA+ +tTyAGcwCCdCGGAsAGyrCC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m86_REST_m13_known_matrix REST_m13_known_matrix cluster_3 R 1 2 22 +TCAGCACCRYGGACAGYRC++ ++GyrCTGTCCryGGTGCTGa+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m77_REST_m1_GM12878_encode REST_m1_GM12878_encode cluster_3 D 0 7 22 GTCCRTGGTGCTGAA+++++++ +++++++tTCAGCACCayGGAC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m21_KLF1_HUMAN.H11MO.0.A KLF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 8 2 24 ++++++++rGGGyGkGGCyggg++ ++CCCRGCCMCRCCCY++++++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m24_KLF5_HUMAN.H11MO.0.A KLF5_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 8 2 24 ++++++++wGGGtGkGGctggg++ ++CCCAGCCMCACCCW++++++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m8_EGR1_HUMAN.H11MO.0.A EGR1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 4 3 24 ++++grrkGcGkGGGyGGrrr+++ +++YYYCCRCCCMCGCMYYC++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m10_EGR2_HUMAN.H11MO.1.A EGR2_HUMAN.H11MO.1.A cluster_4 D 5 3 24 +++++grkGyGkGGGhGGrgg+++ +++CCYCCDCCCMCRCMYC+++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m22_KLF3_HUMAN.H11MO.0.B KLF3_HUMAN.H11MO.0.B cluster_4 D 3 2 24 +++ggrgrdGGGyGGGGcyggg++ ++CCCRGCCCCRCCCHYCYCC+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m47_SP3_HUMAN.H11MO.0.B SP3_HUMAN.H11MO.0.B cluster_4 D 3 1 24 +++gggrggGGGcGGGGcsrgsg+ +CSCYSGCCCCGCCCCCYCCC+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m32_PATZ1_HUMAN.H11MO.0.C PATZ1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 2 0 24 ++ggGGmgGGGgmkGgrrggGrrg CYYCCCYYCCMKCCCCCKCCCC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m68_ZN467_HUMAN.H11MO.0.C ZN467_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 2 0 24 ++rGGGAGGrGrrrgrrrrrrrrr YYYYYYYYYCYYYCYCCTCCCY++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m62_ZN148_HUMAN.H11MO.0.D ZN148_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 5 4 24 +++++kgggkGGGGGaGGGG++++ ++++CCCCTCCCCCMCCCM+++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m65_ZN281_HUMAN.H11MO.0.A ZN281_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 6 3 24 ++++++gggwGGGGGAGGGGr+++ +++YCCCCTCCCCCWCCC++++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m45_SP2_HUMAN.H11MO.0.A SP2_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 2 0 24 ++sgssrgGrGGCGGGgccggsgs SCSCCGGCCCCGCCYCCYSSCS++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m48_SP4_HUMAN.H11MO.0.A SP4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 2 2 24 ++grgmargrGGCGGrGccrrr++ ++YYYGGCYCCGCCYCYTKCYC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m18_KLF14_HUMAN.H11MO.0.D KLF14_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 5 6 24 +++++rrGkGGGCGTGgy++++++ ++++++RCCACGCCCMCYY+++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m26_KLF9_HUMAN.H11MO.0.C KLF9_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 4 5 24 ++++grrGkGGGCGKGgCc+++++ +++++GGCCMCGCCCMCYYC++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m27_MAZ_HUMAN.H11MO.0.A MAZ_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 1 1 24 +YYYYYYYCYCYCYYCCTCCYYC+ +grrGGaGGrRgrGrgrrrrrrr+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m44_SP1_HUMAN.H11MO.1.A SP1_HUMAN.H11MO.1.A cluster_4 D 6 4 24 ++++++vgGGGGCGGGGCck++++ ++++MGGCCCCGCCCCCB++++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m49_SP4_HUMAN.H11MO.1.A SP4_HUMAN.H11MO.1.A cluster_4 D 4 4 24 ++++GrrrgGGGmGGRGmyk++++ ++++MRKCYCCKCCCCYYYC++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m56_VEZF1_HUMAN.H11MO.0.C VEZF1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 1 1 24 +ggrrrrgrrGGAGgrggrgrrr+ +YYYCYCCYCCTCCYYCYYYYCC+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m58_WT1_HUMAN.H11MO.0.C WT1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 3 1 24 +++rgGvGrRGGAGGrGgrGgrG+ +CYCCYCCYCCTCCYYCBCCY+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m9_EGR2_HUMAN.H11MO.0.A EGR2_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 2 4 24 ++grgrrkGwGkGGGhGGrr++++ ++++YYCCDCCCMCWCMYYCYC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m52_TBX15_HUMAN.H11MO.0.D TBX15_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 2 3 24 ++gGGggGGGggGGGtGGGrg+++ +++CYCCCACCCCCCCCCCCCC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m19_KLF15_HUMAN.H11MO.0.A KLF15_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 2 3 24 ++CCYCYCCCYBCYCCKCCYY+++ +++rRGGmGGrGvrgGGrgrGG++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m64_ZN263_HUMAN.H11MO.0.A ZN263_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 3 1 24 +++YYCCYCCYCYYCCTCCTCCC+ +GGGAGGAggrrGrggrggrr+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m25_KLF6_HUMAN.H11MO.0.A KLF6_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 5 0 24 +++++YYCCMDGCCMCDCCCYYCC ggrrGGGhGKGGchkggrr+++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m20_KLF16_HUMAN.H11MO.0.D KLF16_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 1 4 24 +gkGGGyGkGksgGGgGGGg++++ ++++CCCCCCCCSMCMCRCCCMC+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m43_SP1_HUMAN.H11MO.0.A SP1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 0 2 24 rgGGGGCGGGGCckGGgsggGg++ ++CCCCSCCCMGGCCCCGCCCCCY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m53_TBX1_HUMAN.H11MO.0.D TBX1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 2 2 24 ++MHGCCCACCCCTRCCCACCC++ ++GGGtGGGyAGGGGtGGGcdk++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m59_ZBT17_HUMAN.H11MO.0.A ZBT17_HUMAN.H11MO.0.A cluster_4 D 4 1 24 ++++YYKYCCCTCCCCCWCCYYC+ +grrggwGGGGGAgGGRmrr++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m37_PURA_HUMAN.H11MO.0.D PURA_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 3 4 24 +++CYMYGCCCMCCMMYWCC++++ ++++GGwrkkgGkgGgCrkRG+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m36_PROX1_HUMAN.H11MO.0.D PROX1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 4 3 24 ++++CCCMMSMCGYCYYMCCM+++ +++kggkrrGRcGkskkggg++++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m17_KLF12_HUMAN.H11MO.0.C KLF12_HUMAN.H11MO.0.C cluster_5 D 2 1 14 ++mgGGGCGGGGC+ +GCCCCGCCCCK++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m28_MAZ_HUMAN.H11MO.1.A MAZ_HUMAN.H11MO.1.A cluster_5 D 2 1 14 ++rrGGGmGGGGs+ +SCCCCKCCCYY++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m46_SP2_HUMAN.H11MO.1.B SP2_HUMAN.H11MO.1.B cluster_5 D 1 1 14 +GCCCCGCCYCYY+ +rrGrGGCGGGGc+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m23_KLF4_HUMAN.H11MO.0.A KLF4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_5 D 3 1 14 +++RCCMCRCCCW+ +wGGGyGkGGy+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m33_PATZ1_HUMAN.H11MO.1.C PATZ1_HUMAN.H11MO.1.C cluster_5 D 3 2 14 +++aGGGAGGrG++ ++CYCCTCCCT+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m57_VEZF1_HUMAN.H11MO.1.C VEZF1_HUMAN.H11MO.1.C cluster_5 D 1 1 14 +rrrrGGArGgrr+ +YYCCYTCCYYYY+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m11_EGR4_HUMAN.H11MO.0.D EGR4_HUMAN.H11MO.0.D cluster_5 D 2 1 14 ++KCCCYRCCSCC+ +GGsGGyrGGGm++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m63_ZN219_HUMAN.H11MO.0.D ZN219_HUMAN.H11MO.0.D cluster_5 D 2 0 14 ++grGGGGGGyGGa TCCRCCCCCCYC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m69_ZN740_HUMAN.H11MO.0.D ZN740_HUMAN.H11MO.0.D cluster_5 D 0 0 14 kkkGGGGGGGyrgk MCYRCCCCCCCMMM
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m42_SALL4_HUMAN.H11MO.0.B SALL4_HUMAN.H11MO.0.B cluster_5 D 1 3 14 +CCCWCCCHSC+++ +++gsdGGGwGgG+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m80_REST_m4_GM12878_encode REST_m4_GM12878_encode cluster_6 D 0 0 14 GsassvdGGasaGs SCTSTCCHBSSTSC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m83_REST_m9_HTB-11_encode REST_m9_HTB-11_encode cluster_6 R 0 0 14 SCWSCWSSSWSWSC GswswssswGswGs
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m82_REST_m8_HeLa-S3_encode REST_m8_HeLa-S3_encode cluster_6 D 0 0 14 SCHSGSMSAGSWSC GswsctskscsdGs
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m1_AP2B_HUMAN.H11MO.0.B AP2B_HUMAN.H11MO.0.B cluster_7 D 1 3 14 +GsCyGvGGgs+++ +++SCCCBCRGSC+
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m2_AP2D_HUMAN.H11MO.0.D AP2D_HUMAN.H11MO.0.D cluster_7 D 0 0 14 cGcCyGrGGCgCGt ACGCGCCYCRGGCG
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m67_ZN341_HUMAN.H11MO.0.C ZN341_HUMAN.H11MO.0.C cluster_8 D 0 0 22 grggrrrrggrgrrGGARsAGC GCTSYTCCYYCYCCYYYYCCYC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m70_ZN770_HUMAN.H11MO.0.C ZN770_HUMAN.H11MO.0.C cluster_8 D 0 0 22 gGGAGGCyGaGgcrGGaGgakc GMTCCTCCYGCCTCRGCCTCCC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m51_TAF1_HUMAN.H11MO.0.A TAF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_9 D 0 0 16 rArrwGGmgGmggmgr YCKCCKCCKCCWYYTY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m72_ZSC22_HUMAN.H11MO.0.C ZSC22_HUMAN.H11MO.0.C cluster_9 D 0 0 16 rgkcwGAkGGmGGAGG CCTCCKCCMTCWGMCY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m41_RXRA_HUMAN.H11MO.0.A RXRA_HUMAN.H11MO.0.A cluster_10 D 0 0 20 rrgkgrgrsrrRGGkCArrg CYYTGMCCYYYSYCYCMCYY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m61_ZFX_HUMAN.H11MO.1.A ZFX_HUMAN.H11MO.1.A cluster_10 D 3 0 20 +++kgrrgsvsAGGCCksrg CYSMGGCCTSBSCYYCM+++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m60_ZF64A_HUMAN.H11MO.0.D ZF64A_HUMAN.H11MO.0.D cluster_11 D 2 2 20 ++ggrgCCCgGGAmycwG++ ++CWGRKTCCCGGGCYCC++
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m66_ZN320_HUMAN.H11MO.0.C ZN320_HUMAN.H11MO.0.C cluster_11 D 0 0 20 GkGGGdcCmgGGGGMmwrtG CAYWKKCCCCCKGGHCCCMC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m81_REST_m5_HepG2_encode REST_m5_HepG2_encode cluster_12 D 0 0 11 sssgGSwGCtG CAGCWSCCSSS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m29_MBD2_HUMAN.H11MO.0.B MBD2_HUMAN.H11MO.0.B cluster_13 D 0 0 11 ssSkCCGGmgr YCKCCGGMSSS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m78_REST_m2_U87_encode REST_m2_U87_encode cluster_14 D 0 0 10 TGTCCrtGGT ACCAYGGACA
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m12_FLI1_HUMAN.H11MO.0.A FLI1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_15 D 0 0 18 grrgrmAGGAAGgrrrgr YCYYYCCTTCCTKYCYYC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m50_SPIC_HUMAN.H11MO.0.D SPIC_HUMAN.H11MO.0.D cluster_16 D 0 0 13 krdrrwGgGkrrg CYYMCCCWYYHYM
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m35_PLAG1_HUMAN.H11MO.0.D PLAG1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_17 D 0 0 17 gGrGSsmycwrkAGGGG CCCCTMYWGRKSSCYCC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m3_CTCFL_HUMAN.H11MO.0.A CTCFL_HUMAN.H11MO.0.A cluster_18 D 0 0 17 gCCrsyAGGGGGCGCyv BRGCGCCCCCTRSYGGC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m39_RFX1_HUMAN.H11MO.0.B RFX1_HUMAN.H11MO.0.B cluster_19 D 0 0 22 sssscsGTTGCCAkGGcraCss SSGTYGCCMTGGCAACSGSSSS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m55_THAP1_HUMAN.H11MO.0.C THAP1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_20 D 0 0 22 sGccGCCatstyggctscGGGC GCCCGSAGCCRASATGGCGGCS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m79_REST_m3_PFSK-1_encode REST_m3_PFSK-1_encode cluster_21 D 0 0 10 GGACAGCkCC GGMGCTGTCC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m13_HEY2_HUMAN.H11MO.0.D HEY2_HUMAN.H11MO.0.D cluster_22 D 0 0 17 GbbsGCwCGTGsChybv BVRDGSCACGWGCSVVC
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m40_RREB1_HUMAN.H11MO.0.D RREB1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_23 D 0 0 22 rkskkkGkkGkTGkTTkGkGkt AMCMCMAAMCAMCMMCMMMSMY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m30_NR1H4_HUMAN.H11MO.0.B NR1H4_HUMAN.H11MO.0.B cluster_24 D 0 0 19 rrGGkCArtGrCCbcgvGG CCBCGVGGYCAYTGMCCYY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m34_PAX5_HUMAN.H11MO.0.A PAX5_HUMAN.H11MO.0.A cluster_25 D 0 0 21 scskGggCArCvrAGCGwGAC GTCWCGCTYBGYTGCCCMSGS
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m71_ZNF76_HUMAN.H11MO.0.C ZNF76_HUMAN.H11MO.0.C cluster_26 D 0 0 22 rrkGcmTkCTGGGArwtGtAGT ACTACAWYTCCCAGMAKGCMYY
ncor_0_5_none_miniatura_motifs_m31_NRF1_HUMAN.H11MO.0.A NRF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_27 D 0 0 17 cwsTGCGCATGCGCrrs SYYGCGCATGCGCASWG