/var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/05/11/matrix-clustering_2026-05-11.152643_2HyYHX/matrix-clustering_tables/alignment_table.tab


id name cluster strand offset_up offset_down width aligned_consensus aligned_consensus_rc
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m14_KAISO_HUMAN.H11MO.0.A KAISO_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 0 3 18 sarrymtCGCGAGAr+++ +++YTCTCGCGAKRYYTS
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m74_KAISO_HUMAN.H11MO.0.A KAISO_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 0 3 18 sarrymtCGCGAGAr+++ +++YTCTCGCGAKRYYTS
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m15_KAISO_HUMAN.H11MO.1.A KAISO_HUMAN.H11MO.1.A cluster_1 D 4 3 18 ++++tmtCGCGAGAr+++ +++YTCTCGCGAKA++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m75_KAISO_HUMAN.H11MO.1.A KAISO_HUMAN.H11MO.1.A cluster_1 D 4 3 18 ++++tmtCGCGAGAr+++ +++YTCTCGCGAKA++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m16_KAISO_HUMAN.H11MO.2.A KAISO_HUMAN.H11MO.2.A cluster_1 D 5 1 18 +++++yTsGCrrGArkw+ +WMYTCYYGCSAR+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m76_KAISO_HUMAN.H11MO.2.A KAISO_HUMAN.H11MO.2.A cluster_1 D 5 1 18 +++++yTsGCrrGArkw+ +WMYTCYYGCSAR+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m4_E2F1_HUMAN.H11MO.0.A E2F1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 3 1 18 +++rgrgGGCGGGArrr+ +YYYTCCCGCCCYCY+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m54_TFDP1_HUMAN.H11MO.0.C TFDP1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_1 D 3 1 18 +++rrrrGGCGGGAarr+ +YYTTCCCGCCYYYY+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m6_E2F6_HUMAN.H11MO.0.A E2F6_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 5 0 18 +++++rrGGCGGGArrrr YYYYTCCCGCCYY+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m7_E2F7_HUMAN.H11MO.0.B E2F7_HUMAN.H11MO.0.B cluster_1 D 5 0 18 +++++grGGCGGGRaarr YYTTYCCCGCCYC+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m5_E2F4_HUMAN.H11MO.0.A E2F4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_1 D 4 1 18 ++++HYTYCCCGCCCYS+ +srgGGCGGGRard++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m29_MBD2_HUMAN.H11MO.0.B MBD2_HUMAN.H11MO.0.B cluster_1 D 5 2 18 +++++YCKCCGGMSSS++ ++ssSkCCGGmgr+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m38_REST_HUMAN.H11MO.0.A REST_HUMAN.H11MO.0.A cluster_2 R 0 0 22 KGGMGCTGTCCRTGGTGCTGAA tTCAGcACCayGGACAGckcCm
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m73_REST_HUMAN.H11MO.0.A REST_HUMAN.H11MO.0.A cluster_2 R 0 0 22 KGGMGCTGTCCRTGGTGCTGAA tTCAGcACCayGGACAGckcCm
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m84_REST_m11_known_matrix REST_m11_known_matrix cluster_2 R 1 0 22 +GSYKCTGTCCGYGGTGCTGAA TTCAGCACCrCGGACAGmrsC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m87_REST_m14_known_matrix REST_m14_known_matrix cluster_2 R 1 0 22 +GGMGCTGTCCATGGTGCTGAA tTCAGcACCatGGACAGckcC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m85_REST_m12_known_matrix REST_m12_known_matrix cluster_2 R 1 0 22 +GGYRCTSTCCGHGGWGCTRAA tTyAGcwCCdCGGAsAGyrCC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m86_REST_m13_known_matrix REST_m13_known_matrix cluster_2 D 2 1 22 ++GyrCTGTCCryGGTGCTGa+ +TCAGCACCRYGGACAGYRC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m80_REST_m4_GM12878_encode REST_m4_GM12878_encode cluster_2 R 4 4 22 ++++SCTSTCCHBSSTSC++++ ++++GsassvdGGasaGs++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m83_REST_m9_HTB-11_encode REST_m9_HTB-11_encode cluster_2 D 4 4 22 ++++GswswssswGswGs++++ ++++SCWSCWSSSWSWSC++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m82_REST_m8_HeLa-S3_encode REST_m8_HeLa-S3_encode cluster_2 R 4 4 22 ++++SCHSGSMSAGSWSC++++ ++++GswsctskscsdGs++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m77_REST_m1_GM12878_encode REST_m1_GM12878_encode cluster_2 R 7 0 22 +++++++GTCCRTGGTGCTGAA tTCAGCACCayGGAC+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m78_REST_m2_U87_encode REST_m2_U87_encode cluster_2 D 6 6 22 ++++++TGTCCrtGGT++++++ ++++++ACCAYGGACA++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m79_REST_m3_PFSK-1_encode REST_m3_PFSK-1_encode cluster_2 D 8 4 22 ++++++++GGMGCTGTCC++++ ++++GGACAGCkCC++++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m21_KLF1_HUMAN.H11MO.0.A KLF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 8 3 25 ++++++++rGGGyGkGGCyggg+++ +++CCCRGCCMCRCCCY++++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m24_KLF5_HUMAN.H11MO.0.A KLF5_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 8 3 25 ++++++++wGGGtGkGGctggg+++ +++CCCAGCCMCACCCW++++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m8_EGR1_HUMAN.H11MO.0.A EGR1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 4 4 25 ++++grrkGcGkGGGyGGrrr++++ ++++YYYCCRCCCMCGCMYYC++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m10_EGR2_HUMAN.H11MO.1.A EGR2_HUMAN.H11MO.1.A cluster_3 D 5 4 25 +++++grkGyGkGGGhGGrgg++++ ++++CCYCCDCCCMCRCMYC+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m22_KLF3_HUMAN.H11MO.0.B KLF3_HUMAN.H11MO.0.B cluster_3 D 3 3 25 +++ggrgrdGGGyGGGGcyggg+++ +++CCCRGCCCCRCCCHYCYCC+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m47_SP3_HUMAN.H11MO.0.B SP3_HUMAN.H11MO.0.B cluster_3 D 3 2 25 +++gggrggGGGcGGGGcsrgsg++ ++CSCYSGCCCCGCCCCCYCCC+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m17_KLF12_HUMAN.H11MO.0.C KLF12_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 7 7 25 +++++++mgGGGCGGGGC+++++++ +++++++GCCCCGCCCCK+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m28_MAZ_HUMAN.H11MO.1.A MAZ_HUMAN.H11MO.1.A cluster_3 D 7 7 25 +++++++rrGGGmGGGGs+++++++ +++++++SCCCCKCCCYY+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m32_PATZ1_HUMAN.H11MO.0.C PATZ1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 2 1 25 ++ggGGmgGGGgmkGgrrggGrrg+ +CYYCCCYYCCMKCCCCCKCCCC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m68_ZN467_HUMAN.H11MO.0.C ZN467_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 2 1 25 ++rGGGAGGrGrrrgrrrrrrrrr+ +YYYYYYYYYCYYYCYCCTCCCY++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m62_ZN148_HUMAN.H11MO.0.D ZN148_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 5 5 25 +++++kgggkGGGGGaGGGG+++++ +++++CCCCTCCCCCMCCCM+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m65_ZN281_HUMAN.H11MO.0.A ZN281_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 6 4 25 ++++++gggwGGGGGAGGGGr++++ ++++YCCCCTCCCCCWCCC++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m45_SP2_HUMAN.H11MO.0.A SP2_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 2 1 25 ++sgssrgGrGGCGGGgccggsgs+ +SCSCCGGCCCCGCCYCCYSSCS++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m48_SP4_HUMAN.H11MO.0.A SP4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 2 3 25 ++grgmargrGGCGGrGccrrr+++ +++YYYGGCYCCGCCYCYTKCYC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m18_KLF14_HUMAN.H11MO.0.D KLF14_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 5 7 25 +++++rrGkGGGCGTGgy+++++++ +++++++RCCACGCCCMCYY+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m26_KLF9_HUMAN.H11MO.0.C KLF9_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 4 6 25 ++++grrGkGGGCGKGgCc++++++ ++++++GGCCMCGCCCMCYYC++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m46_SP2_HUMAN.H11MO.1.B SP2_HUMAN.H11MO.1.B cluster_3 D 6 7 25 ++++++GCCCCGCCYCYY+++++++ +++++++rrGrGGCGGGGc++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m27_MAZ_HUMAN.H11MO.0.A MAZ_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 1 2 25 +YYYYYYYCYCYCYYCCTCCYYC++ ++grrGGaGGrRgrGrgrrrrrrr+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m44_SP1_HUMAN.H11MO.1.A SP1_HUMAN.H11MO.1.A cluster_3 D 6 5 25 ++++++vgGGGGCGGGGCck+++++ +++++MGGCCCCGCCCCCB++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m49_SP4_HUMAN.H11MO.1.A SP4_HUMAN.H11MO.1.A cluster_3 D 4 5 25 ++++GrrrgGGGmGGRGmyk+++++ +++++MRKCYCCKCCCCYYYC++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m56_VEZF1_HUMAN.H11MO.0.C VEZF1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 1 2 25 +ggrrrrgrrGGAGgrggrgrrr++ ++YYYCYCCYCCTCCYYCYYYYCC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m58_WT1_HUMAN.H11MO.0.C WT1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 3 2 25 +++rgGvGrRGGAGGrGgrGgrG++ ++CYCCYCCYCCTCCYYCBCCY+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m9_EGR2_HUMAN.H11MO.0.A EGR2_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 2 5 25 ++grgrrkGwGkGGGhGGrr+++++ +++++YYCCDCCCMCWCMYYCYC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m52_TBX15_HUMAN.H11MO.0.D TBX15_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 2 4 25 ++gGGggGGGggGGGtGGGrg++++ ++++CYCCCACCCCCCCCCCCCC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m19_KLF15_HUMAN.H11MO.0.A KLF15_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 2 4 25 ++CCYCYCCCYBCYCCKCCYY++++ ++++rRGGmGGrGvrgGGrgrGG++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m23_KLF4_HUMAN.H11MO.0.A KLF4_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 8 7 25 ++++++++RCCMCRCCCW+++++++ +++++++wGGGyGkGGy++++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m64_ZN263_HUMAN.H11MO.0.A ZN263_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 3 2 25 +++YYCCYCCYCYYCCTCCTCCC++ ++GGGAGGAggrrGrggrggrr+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m25_KLF6_HUMAN.H11MO.0.A KLF6_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 5 1 25 +++++YYCCMDGCCMCDCCCYYCC+ +ggrrGGGhGKGGchkggrr+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m20_KLF16_HUMAN.H11MO.0.D KLF16_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 1 5 25 +gkGGGyGkGksgGGgGGGg+++++ +++++CCCCCCCCSMCMCRCCCMC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m43_SP1_HUMAN.H11MO.0.A SP1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 0 3 25 rgGGGGCGGGGCckGGgsggGg+++ +++CCCCSCCCMGGCCCCGCCCCCY
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m53_TBX1_HUMAN.H11MO.0.D TBX1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 2 3 25 ++MHGCCCACCCCTRCCCACCC+++ +++GGGtGGGyAGGGGtGGGcdk++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m33_PATZ1_HUMAN.H11MO.1.C PATZ1_HUMAN.H11MO.1.C cluster_3 D 8 8 25 ++++++++aGGGAGGrG++++++++ ++++++++CYCCTCCCT++++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m57_VEZF1_HUMAN.H11MO.1.C VEZF1_HUMAN.H11MO.1.C cluster_3 D 6 7 25 ++++++rrrrGGArGgrr+++++++ +++++++YYCCYTCCYYYY++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m59_ZBT17_HUMAN.H11MO.0.A ZBT17_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 4 2 25 ++++YYKYCCCTCCCCCWCCYYC++ ++grrggwGGGGGAgGGRmrr++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m11_EGR4_HUMAN.H11MO.0.D EGR4_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 7 7 25 +++++++KCCCYRCCSCC+++++++ +++++++GGsGGyrGGGm+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m63_ZN219_HUMAN.H11MO.0.D ZN219_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 7 6 25 +++++++grGGGGGGyGGa++++++ ++++++TCCRCCCCCCYC+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m69_ZN740_HUMAN.H11MO.0.D ZN740_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 5 6 25 +++++kkkGGGGGGGyrgk++++++ ++++++MCYRCCCCCCCMMM+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m42_SALL4_HUMAN.H11MO.0.B SALL4_HUMAN.H11MO.0.B cluster_3 D 6 9 25 ++++++CCCWCCCHSC+++++++++ +++++++++gsdGGGwGgG++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m37_PURA_HUMAN.H11MO.0.D PURA_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 3 5 25 +++CYMYGCCCMCCMMYWCC+++++ +++++GGwrkkgGkgGgCrkRG+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m67_ZN341_HUMAN.H11MO.0.C ZN341_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 3 0 25 +++grggrrrrggrgrrGGARsAGC GCTSYTCCYYCYCCYYYYCCYC+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m70_ZN770_HUMAN.H11MO.0.C ZN770_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 3 0 25 +++gGGAGGCyGaGgcrGGaGgakc GMTCCTCCYGCCTCRGCCTCCC+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m51_TAF1_HUMAN.H11MO.0.A TAF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 5 4 25 +++++rArrwGGmgGmggmgr++++ ++++YCKCCKCCKCCWYYTY+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m72_ZSC22_HUMAN.H11MO.0.C ZSC22_HUMAN.H11MO.0.C cluster_3 D 5 4 25 +++++rgkcwGAkGGmGGAGG++++ ++++CCTCCKCCMTCWGMCY+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m36_PROX1_HUMAN.H11MO.0.D PROX1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 4 4 25 ++++CCCMMSMCGYCYYMCCM++++ ++++kggkrrGRcGkskkggg++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m81_REST_m5_HepG2_encode REST_m5_HepG2_encode cluster_3 D 6 8 25 ++++++CAGCWSCCSSS++++++++ ++++++++sssgGSwGCtG++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m12_FLI1_HUMAN.H11MO.0.A FLI1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_3 D 3 4 25 +++YCYYYCCTTCCTKYCYYC++++ ++++grrgrmAGGAAGgrrrgr+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m50_SPIC_HUMAN.H11MO.0.D SPIC_HUMAN.H11MO.0.D cluster_3 D 7 5 25 +++++++CYYMCCCWYYHYM+++++ +++++krdrrwGgGkrrg+++++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m1_AP2B_HUMAN.H11MO.0.B AP2B_HUMAN.H11MO.0.B cluster_4 D 5 5 20 +++++GsCyGvGGgs+++++ +++++SCCCBCRGSC+++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m2_AP2D_HUMAN.H11MO.0.D AP2D_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 4 2 20 ++++cGcCyGrGGCgCGt++ ++ACGCGCCYCRGGCG++++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m60_ZF64A_HUMAN.H11MO.0.D ZF64A_HUMAN.H11MO.0.D cluster_4 D 2 2 20 ++ggrgCCCgGGAmycwG++ ++CWGRKTCCCGGGCYCC++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m66_ZN320_HUMAN.H11MO.0.C ZN320_HUMAN.H11MO.0.C cluster_4 D 0 0 20 GkGGGdcCmgGGGGMmwrtG CAYWKKCCCCCKGGHCCCMC
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m41_RXRA_HUMAN.H11MO.0.A RXRA_HUMAN.H11MO.0.A cluster_5 D 0 0 20 rrgkgrgrsrrRGGkCArrg CYYTGMCCYYYSYCYCMCYY
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m61_ZFX_HUMAN.H11MO.1.A ZFX_HUMAN.H11MO.1.A cluster_5 D 3 0 20 +++kgrrgsvsAGGCCksrg CYSMGGCCTSBSCYYCM+++
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m3_CTCFL_HUMAN.H11MO.0.A CTCFL_HUMAN.H11MO.0.A cluster_6 D 1 0 18 +gCCrsyAGGGGGCGCyv BRGCGCCCCCTRSYGGC+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m35_PLAG1_HUMAN.H11MO.0.D PLAG1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_6 R 0 1 18 CCCCTMYWGRKSSCYCC+ +gGrGSsmycwrkAGGGG
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m39_RFX1_HUMAN.H11MO.0.B RFX1_HUMAN.H11MO.0.B cluster_7 D 1 0 23 +sssscsGTTGCCAkGGcraCss SSGTYGCCMTGGCAACSGSSSS+
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m55_THAP1_HUMAN.H11MO.0.C THAP1_HUMAN.H11MO.0.C cluster_7 R 0 1 23 GCCCGSAGCCRASATGGCGGCS+ +sGccGCCatstyggctscGGGC
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m13_HEY2_HUMAN.H11MO.0.D HEY2_HUMAN.H11MO.0.D cluster_8 D 0 0 17 GbbsGCwCGTGsChybv BVRDGSCACGWGCSVVC
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m40_RREB1_HUMAN.H11MO.0.D RREB1_HUMAN.H11MO.0.D cluster_9 D 0 0 22 rkskkkGkkGkTGkTTkGkGkt AMCMCMAAMCAMCMMCMMMSMY
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m30_NR1H4_HUMAN.H11MO.0.B NR1H4_HUMAN.H11MO.0.B cluster_10 D 0 0 19 rrGGkCArtGrCCbcgvGG CCBCGVGGYCAYTGMCCYY
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m34_PAX5_HUMAN.H11MO.0.A PAX5_HUMAN.H11MO.0.A cluster_11 D 0 0 21 scskGggCArCvrAGCGwGAC GTCWCGCTYBGYTGCCCMSGS
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m71_ZNF76_HUMAN.H11MO.0.C ZNF76_HUMAN.H11MO.0.C cluster_12 D 0 0 22 rrkGcmTkCTGGGArwtGtAGT ACTACAWYTCCCAGMAKGCMYY
ncor_0_4_none_miniatura_motifs_m31_NRF1_HUMAN.H11MO.0.A NRF1_HUMAN.H11MO.0.A cluster_13 D 0 0 17 cwsTGCGCATGCGCrrs SYYGCGCATGCGCASWG