; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/05/16/oligo-analysis_2026-05-16.125221_GFR1LJ_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/05/16/oligo-analysis_2026-05-16.125221_GFR1LJ_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/05/16/oligo-analysis_2026-05-16.125221_GFR1LJ_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/05/16/oligo-analysis_2026-05-16.125221_GFR1LJ_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 450 415 219 881 892 102 919 915 125 908 317 379 417
c 120 117 83 20 21 30 20 20 27 19 104 139 143
g 171 184 583 50 32 817 26 20 794 22 407 240 178
t 240 265 96 30 36 32 16 26 35 32 153 223 243
//
a 377 428 377 873 131 906 99 910 65 887 350 430
c 123 135 132 21 594 9 27 8 16 24 142 132
g 203 156 214 23 159 11 777 10 838 20 213 168
t 249 233 229 35 68 26 49 24 33 21 247 222
//
a 31 35 0 0 0 0 0 107 37 38
c 20 12 107 107 0 0 0 0 20 19
g 22 21 0 0 0 0 107 0 20 26
t 34 39 0 0 107 107 0 0 30 24
//
a 290 300 81 797 816 74 41 34 62 270 322
c 148 157 692 19 8 642 6 14 42 141 116
g 115 128 29 11 15 69 16 17 686 144 139
t 306 274 57 32 20 74 796 794 69 304 282
//
a 30 26 6 5 5 4 4 8 4 10 8 11 35 39
c 20 30 6 91 2 95 1 11 0 8 73 89 19 22
g 21 24 3 8 1 4 3 84 2 70 7 2 23 23
t 43 34 99 10 106 11 106 11 108 26 26 12 37 30
//
a 35 39 29 86 7 10 4 8 12 94 12 87 7 12 33 27
c 21 13 16 3 1 74 1 6 74 1 4 5 4 43 15 17
g 17 15 43 4 5 4 1 74 6 1 74 1 3 16 13 21
t 27 33 12 7 87 12 94 12 8 4 10 7 86 29 39 35
//
a 99 95 255 17 10 7 11 10 22 124 92
c 52 84 6 206 3 1 4 10 19 41 54
g 38 36 5 14 246 1 244 231 217 43 52
t 84 58 7 36 14 264 14 22 15 65 75
//
a 65 67 168 9 8 2 4 10 19 166 65 55
c 26 44 0 13 4 0 2 2 6 3 33 31
g 34 30 3 8 152 3 167 156 148 1 33 30
t 55 39 9 150 16 175 7 12 7 10 49 64
//
a 44 26 0 0 0 99 0 99 34 37
c 14 18 99 0 0 0 0 0 13 20
g 17 25 0 0 99 0 99 0 18 15
t 24 30 0 99 0 0 0 0 34 27
//
a 42 38 99 0 0 99 99 0 47 28
c 16 17 0 99 0 0 0 0 18 30
g 17 28 0 0 99 0 0 99 12 16
t 24 16 0 0 0 0 0 0 22 25
//
a 354 311 84 657 665 59 699 699 80 688 317 279 319
c 93 81 33 16 18 17 11 13 19 16 127 96 114
g 118 133 583 37 28 647 17 14 619 17 142 200 131
t 174 214 39 29 28 16 12 13 21 18 153 164 175
//
a 36 25 0 0 0 0 0 93 34 34
c 14 19 93 0 0 93 0 0 14 11
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