; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/06/18/oligo-analysis_2026-06-18.142551_KhL7ja_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/06/18/oligo-analysis_2026-06-18.142551_KhL7ja_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/06/18/oligo-analysis_2026-06-18.142551_KhL7ja_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/06/18/oligo-analysis_2026-06-18.142551_KhL7ja_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 332 370 519 729 230 31 15 0 22 882 197 167 495 367 282
c 150 144 94 63 2 17 869 901 861 4 44 79 61 115 152
g 113 93 65 33 672 858 15 4 2 19 42 52 80 156 187
t 320 308 237 90 11 9 16 10 30 10 632 617 279 277 294
//
a 286 314 514 705 625 36 11 10 24 794 157 149 422 354 276
c 143 146 82 33 1 15 779 796 783 4 38 64 70 112 128
g 110 90 66 26 190 756 15 8 3 15 34 54 66 154 167
t 287 276 164 62 10 19 21 12 16 13 597 559 268 206 255
//
a 348 403 687 789 212 44 24 12 66 928 673 141 406 394
c 180 133 63 43 9 48 875 927 859 11 39 70 115 144
g 128 111 56 43 720 864 32 9 10 14 39 45 116 175
t 316 325 166 97 31 16 41 24 37 19 221 716 335 259
//
a 108 126 283 34 20 271 18 14 72 47 19 283 133 123
c 111 57 21 308 6 25 322 4 18 289 16 21 79 41
g 56 116 27 7 328 50 8 338 247 4 319 30 61 103
t 91 67 35 17 12 20 18 10 29 26 12 32 93 99
//
a 297 284 277 631 687 18 46 10 30 7 11 110 532 346 304
c 183 160 87 62 34 30 5 2 15 897 725 89 65 96 139
g 150 119 69 72 31 2 868 919 876 6 8 68 94 143 147
t 304 371 501 169 182 884 15 3 13 24 190 667 243 349 344
//
a 27 40 10 4 10 4 2 7 10 2 9 7 10 8 11 20 32
c 45 19 14 105 4 87 116 1 81 111 1 24 91 6 17 44 15
g 13 28 6 5 82 8 2 104 6 0 104 4 3 91 8 20 36
t 35 33 90 6 24 21 0 8 23 7 6 85 16 15 84 36 37
//
a 49 52 99 18 17 115 10 4 26 19 4 27 113 12 117 48 54
c 41 18 12 108 4 5 121 1 9 109 2 8 21 3 5 27 21
g 28 45 13 9 121 21 5 141 104 3 139 106 4 121 17 29 48
t 30 33 24 13 6 7 12 2 9 17 3 7 10 12 9 44 25
//
a 321 310 296 776 731 13 39 12 37 6 11 313 427 362
c 202 177 99 45 33 21 5 5 48 965 817 123 111 123
g 161 122 70 54 48 3 944 983 899 6 4 125 144 169
t 320 395 539 129 192 967 16 4 20 27 172 443 322 350
//
a 96 125 44 6 12 39 57 19 475 158 143
c 228 48 403 506 4 22 422 5 14 122 65
g 74 171 37 8 506 437 8 499 23 94 178
t 132 186 46 10 8 32 43 7 18 156 144
//
a 307 316 824 83 56 872 94 60 840 319 274
c 274 134 39 794 21 14 757 20 22 228 130
g 167 324 37 32 849 44 42 857 45 167 342
t 201 175 49 40 23 19 56 12 42 235 203
//
a 328 298 443 158 25 12 5 16 893 160 109 464 365 281
c 149 136 170 4 7 866 915 868 3 34 46 70 110 150
g 108 99 123 757 889 25 4 3 22 27 38 99 169 190
t 344 396 193 10 8 26 5 42 11 708 736 296 285 308
//
a 201 191 64 38 748 55 16 30 61 285 210
c 160 193 651 15 21 8 19 678 47 141 161
g 171 119 46 748 18 8 10 32 642 178 141
t 292 321 63 23 37 753 779 84 74 220 312
//
a 335 427 357 7 29 6 15 2 15 52 182 332 319
c 84 97 150 15 6 3 5 910 702 30 58 97 116
g 119 144 84 3 892 934 912 6 2 46 91 134 174
t 407 277 354 920 18 2 13 27 226 817 614 382 336
//
a 340 383 614 818 225 30 16 0 14 918 354 287 413
c 168 132 83 46 2 5 902 932 895 2 159 142 107
g 118 100 67 26 702 902 7 4 5 14 72 95 86
t 316 327 178 52 13 5 17 6 28 8 357 418 336
//
a 134 130 347 17 8 29 27 356 32 341 137 125
c 79 71 7 15 330 6 6 10 9 16 64 51
g 69 114 13 10 10 325 340 5 327 16 84 115
t 99 66 14 339 33 21 8 10 13 8 96 90
//
a 180 262 0 578 0 578 0 578 185 235
c 102 79 0 0 0 0 0 0 91 80
g 149 118 578 0 578 0 578 0 178 133
t 147 119 0 0 0 0 0 0 124 130
//
a 80 86 16 7 17 11 7 13 16 13 22 35 58 55
c 82 41 24 254 6 211 255 3 38 245 4 172 87 49
g 35 66 15 7 215 8 3 255 20 5 232 21 41 99
t 82 86 224 11 41 49 14 8 205 16 21 51 93 76
//
a 364 370 554 777 177 31 15 12 52 939 225 473 428 381
c 163 163 95 70 6 42 917 928 883 3 49 91 95 136
g 127 106 66 38 763 887 18 10 6 20 39 67 90 160
t 315 330 254 84 23 9 19 19 28 7 656 338 356 292
//
a 573 661 319 138 1625 1575 84 1654 1620 605 718
c 234 285 1123 60 17 70 41 37 31 228 346
g 542 328 134 1509 83 48 1594 45 50 585 324
t 414 489 187 56 38 70 44 27 62 345 375
//
a 22 21 9 8 12 5 3 11 5 1 8 3 5 8 10 25 23
c 41 18 74 87 5 79 99 2 89 107 3 19 95 5 8 32 20
g 15 22 5 2 14 4 5 85 5 0 93 7 1 81 12 12 30
t 32 49 22 13 79 22 3 12 11 2 6 81 9 16 80 41 37
//
; Host name rsat
; Job started 2026-06-18.142605
; Job done 2026-06-18.142605
; Seconds 0.14
; user 0.14
; system 0.01
; cuser 0
; csystem 0