; dna-pattern -v 1 -pl $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/07/10/dna-pattern_2026-07-10.143721_RhADNM.pat -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/07/10/tmp_sequence_2026-07-10.143721_acpfZv.fasta -format fasta -return sites -origin -0 -N 0 -return limits -noov -2str -subst 0
; Citation: van Helden et al. (2000). Yeast 16(2), 177-187.
; Input file $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/07/10/tmp_sequence_2026-07-10.143721_acpfZv.fasta
; Input format fasta
; Pattern file $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/07/10/dna-pattern_2026-07-10.143721_RhADNM.pat
; Search method regexp
; Threshold 0
; Allowed substitutions 0
; Return fields
; limits
; sites
; Patterns
; seq id score
; CANNTG CANNTG 1
;
; Matching positions
; PatID Strand Pattern SeqID Start End matching_seq Score
START_END DR - Pso01G07810.0 -2822 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -2581 -2576 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -2434 -2429 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -2373 -2368 CAGCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -2300 -2295 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -2187 -2182 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1886 -1881 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1803 -1798 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1767 -1762 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1755 -1750 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1719 -1714 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1680 -1675 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1629 -1624 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1415 -1410 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1392 -1387 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1293 -1288 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -1230 -1225 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -766 -761 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso01G07810.0 -683 -678 CATTTG 1.00
START_END DR - Pso10G19420.0 -2502 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -2390 -2385 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -1725 -1720 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -1112 -1107 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -1032 -1027 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -881 -876 CAGATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -783 -778 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -757 -752 CAGCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso10G19420.0 -378 -373 CAAGTG 1.00
START_END DR - Pso11G05230.0 -2702 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -2592 -2587 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -2257 -2252 CATGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -2230 -2225 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -2139 -2134 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -838 -833 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G05230.0 -218 -213 CAGGTG 1.00
START_END DR - Pso02G15670.0 -2564 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2498 -2493 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2277 -2272 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2244 -2239 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2234 -2229 CAGATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2185 -2180 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2173 -2168 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -2116 -2111 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -1254 -1249 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -1024 -1019 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -968 -963 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -956 -951 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -853 -848 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -813 -808 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -722 -717 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -707 -702 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -388 -383 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso02G15670.0 -312 -307 CAGATG 1.00
START_END DR - Pso03G47230.0 -2627 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -2302 -2297 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1555 -1550 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1482 -1477 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1418 -1413 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1338 -1333 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1308 -1303 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -1195 -1190 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -476 -471 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G47230.0 -414 -409 CACATG 1.00
START_END DR - Pso03G27150.0 -3211 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -3201 -3196 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -2661 -2656 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -2646 -2641 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -2494 -2489 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -2144 -2139 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -1518 -1513 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -723 -718 CATGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -653 -648 CATGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso03G27150.0 -319 -314 CACATG 1.00
START_END DR - Pso04G29530.0 -2677 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -2594 -2589 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -2528 -2523 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -2504 -2499 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -2077 -2072 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -2028 -2023 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -1270 -1265 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -594 -589 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -343 -338 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G29530.0 -202 -197 CATATG 1.00
START_END DR - Pso04G21340.0 -2503 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -2302 -2297 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -2259 -2254 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -1906 -1901 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -1685 -1680 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -1586 -1581 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -1393 -1388 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -1381 -1376 CACCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -783 -778 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -354 -349 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso04G21340.0 -13 -8 CAAATG 1.00
START_END DR - Pso05G47900.0 -2809 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -2005 -2000 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1698 -1693 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1399 -1394 CATGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1351 -1346 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1309 -1304 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1183 -1178 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1177 -1172 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -1068 -1063 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -874 -869 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -839 -834 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -812 -807 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -803 -798 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -754 -749 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -666 -661 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -509 -504 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -396 -391 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso05G47900.0 -130 -125 CACATG 1.00
START_END DR - Pso06G26560.0 -2826 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -2694 -2689 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -2515 -2510 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -2439 -2434 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -2421 -2416 CAGGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -2031 -2026 CAGATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -1930 -1925 CACCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -1435 -1430 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -1410 -1405 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -1172 -1167 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G26560.0 -429 -424 CAGGTG 1.00
START_END DR - Pso06G10480.0 -3111 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -3049 -3044 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -2395 -2390 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -1612 -1607 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -1300 -1295 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -1030 -1025 CACCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -787 -782 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -764 -759 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -569 -564 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso06G10480.0 -164 -159 CATTTG 1.00
START_END DR - Pso07G00740.0 -2825 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G00740.0 -2643 -2638 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G00740.0 -2001 -1996 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G00740.0 -262 -257 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G00740.0 -73 -68 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G00740.0 -6 -1 CACATG 1.00
START_END DR - Pso07G30400.0 -2572 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -2538 -2533 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1911 -1906 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1890 -1885 CAGATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1721 -1716 CAGGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1598 -1593 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1129 -1124 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso07G30400.0 -1099 -1094 CATTTG 1.00
START_END DR - Pso08G00790.0 -2737 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G00790.0 -2664 -2659 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G00790.0 -1888 -1883 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G00790.0 -1205 -1200 CACCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G00790.0 -575 -570 CACATG 1.00
START_END DR - Pso08G20840.0 -3481 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -3010 -3005 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1951 -1946 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1906 -1901 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1699 -1694 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1689 -1684 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1677 -1672 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1378 -1373 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1143 -1138 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -1049 -1044 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -973 -968 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -769 -764 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -736 -731 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -485 -480 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -232 -227 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso08G20840.0 -218 -213 CATTTG 1.00
START_END DR - Pso09G11380.0 -2068 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -1935 -1930 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -1604 -1599 CAGGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -1563 -1558 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -1429 -1424 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -1237 -1232 CACCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -776 -771 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -526 -521 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -423 -418 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G11380.0 -6 -1 CAGATG 1.00
START_END DR - Pso09G13710.0 -3284 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -2959 -2954 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -2952 -2947 CATATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -2803 -2798 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -2490 -2485 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -2240 -2235 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -1929 -1924 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -1740 -1735 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -1727 -1722 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -1472 -1467 CAGATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -1406 -1401 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -477 -472 CAGTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -174 -169 CAGCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso09G13710.0 -63 -58 CAAATG 1.00
START_END DR - PsoUNG04320.0 -2599 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -2322 -2317 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -2262 -2257 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -2133 -2128 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -1731 -1726 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -1647 -1642 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -1398 -1393 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -1016 -1011 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -905 -900 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -621 -616 CAACTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG04320.0 -392 -387 CATTTG 1.00
START_END DR - PsoUNG22410.0 -3291 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -2848 -2843 CATGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -2812 -2807 CATCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -2772 -2767 CACGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -2658 -2653 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -2217 -2212 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -1691 -1686 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -1205 -1200 CACATG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -885 -880 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -743 -738 CAGCTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -649 -644 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -504 -499 CATTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG PsoUNG22410.0 -432 -427 CATTTG 1.00
START_END DR - Pso11G03990.0 -2746 -1 - 0.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -2656 -2651 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -2587 -2582 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -2482 -2477 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -1944 -1939 CAAATG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -1422 -1417 CACTTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -930 -925 CAATTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -745 -740 CAAGTG 1.00
CANNTG DR CANNTG Pso11G03990.0 -333 -328 CACGTG 1.00
; Host name rsat
; Job started 2026-07-10.143721
; Job done 2026-07-10.143721
; Seconds 0.12
; user 0.12
; system 0.01
; cuser 0
; csystem 0