; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/08/11/oligo-analysis_2026-08-11.180032_nUdn2U_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/08/11/oligo-analysis_2026-08-11.180032_nUdn2U_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/08/11/oligo-analysis_2026-08-11.180032_nUdn2U_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/08/11/oligo-analysis_2026-08-11.180032_nUdn2U_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 77 71 9 13 214 16 212 5 15 13 87 79
c 40 35 12 196 2 190 2 3 4 21 31 34
g 36 38 8 6 1 9 8 1 196 176 42 28
t 71 80 195 9 7 9 2 215 9 14 64 83
//
a 259 172 237 57 527 43 527 79 545 46 53 488 52 60 202 197
c 73 97 91 24 17 20 20 371 10 26 28 14 11 22 89 85
g 77 75 96 20 17 13 19 26 11 12 26 29 18 19 86 90
t 207 272 192 515 55 540 50 140 50 532 509 85 535 515 239 244
//
a 348 358 768 776 127 726 774 63 134 83 127 759 319 325
c 136 132 28 21 42 50 23 18 51 26 54 20 129 126
g 141 146 31 33 39 32 24 16 580 21 581 45 117 143
t 264 253 62 59 681 81 68 792 124 759 127 65 324 295
//
a 1610 1694 3940 3981 383 355 3905 314 304 1371 1531
c 705 704 155 96 137 159 116 97 94 558 557
g 582 571 110 100 105 159 164 140 144 726 688
t 1643 1571 335 363 3915 3867 355 3989 3998 1885 1764
//
a 864 886 140 282 2285 128 149 116 2123 765 843
c 402 386 74 1847 39 43 49 71 92 396 399
g 331 339 58 118 46 44 78 61 84 358 357
t 946 932 2271 296 173 2328 2267 2295 244 1024 944
//
a 957 1080 2177 2205 368 150 2170 188 2148 865 961
c 374 395 45 54 1632 76 73 68 45 325 303
g 337 296 50 38 97 39 51 58 71 343 322
t 733 630 129 104 304 2136 107 2087 137 868 815
//
a 141 146 390 0 0 0 390 390 154 147
c 56 60 0 0 390 0 0 0 68 71
g 56 48 0 0 0 0 0 0 49 54
t 137 136 0 390 0 390 0 0 119 118
//
a 1639 1710 3795 3773 368 335 3670 361 3640 1467 1638
c 682 669 106 98 149 180 108 119 94 577 519
g 504 504 103 105 97 118 130 148 144 582 629
t 1408 1350 229 257 3619 3600 325 3605 355 1607 1447
//
a 226 270 550 564 83 555 106 567 53 67 526 46 50 201 211
c 106 109 24 14 20 20 410 16 22 27 8 24 22 93 91
g 93 90 20 20 13 24 20 15 17 37 20 14 21 93 97
t 223 179 54 50 532 49 112 50 556 517 94 564 555 261 249
//
a 336 370 813 858 123 863 26 54 97 328 283
c 155 139 55 14 685 2 5 21 32 115 161
g 158 150 16 15 30 12 4 765 668 176 149
t 265 255 30 27 76 37 879 74 117 295 321
//
a 87 110 19 268 7 10 17 267 6 23 72 95
c 53 43 221 3 5 9 244 1 3 17 55 45
g 45 55 17 3 1 244 9 5 3 221 43 53
t 95 72 23 6 267 17 10 7 268 19 110 87
//
a 146 146 0 411 0 411 411 411 152 145
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g 69 61 411 0 0 0 0 0 62 67
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//
a 71 66 177 0 0 177 177 0 71 74
c 23 18 0 0 0 0 0 177 28 23
g 20 29 0 177 0 0 0 0 18 21
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//
a 610 650 1082 447 82 305 70 1528 61 1506 215 658 489
c 213 201 119 164 25 64 40 25 33 31 102 210 243
g 241 254 101 619 21 1146 34 55 29 47 88 274 227
t 606 565 368 440 1542 155 1526 62 1547 86 1265 528 711
//
a 128 125 0 344 0 344 344 344 176 136
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