; convert-matrix -v 1 -i $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/08/21/oligo-analysis_2026-08-21.210800_pcU8kP_pssm_count_matrices.tf -from transfac -to tab -return counts -o $RSAT/public_html/tmp/www-data/2026/08/21/oligo-analysis_2026-08-21.210800_pcU8kP_pssm_count_matrices.txt
; Input files
; input /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/08/21/oligo-analysis_2026-08-21.210800_pcU8kP_pssm_count_matrices.tf
; Input format transfac
; Output files
; output /var/www/html/rsat/public_html/tmp/www-data/2026/08/21/oligo-analysis_2026-08-21.210800_pcU8kP_pssm_count_matrices.txt
; Output format tab
; pseudo-weight 1
a 76 31 105 12 110 8 110 4 108 5 72 10 79 12 108 17 103 17 70 20 61 30
c 24 17 10 8 8 1 8 5 11 5 34 5 36 10 11 14 12 11 16 10 23 16
g 21 76 12 109 9 121 11 123 9 121 17 117 13 106 8 94 11 98 35 90 31 68
t 12 9 6 4 6 3 4 1 5 2 10 1 5 5 6 8 7 7 12 13 18 19
//
a 11 13 6 7 7 4 4 4 1 5 1 3 0 2 0 4 2 4 4 6
c 32 16 29 25 26 8 53 6 68 7 67 4 71 1 71 5 64 9 46 13
g 8 15 5 5 30 8 6 29 3 25 2 3 2 3 0 5 2 4 9 17
t 22 29 33 36 10 53 10 34 1 36 3 63 0 67 2 59 5 56 14 37
//
a 24 12 11 1 6 2 4 2 4 4 13 8 46 12 31 18
c 34 99 16 151 8 156 9 151 3 147 19 136 17 114 23 84
g 21 24 16 3 11 3 9 4 4 4 59 8 23 18 28 28
t 86 30 122 10 140 4 143 8 154 10 74 13 79 21 83 35
//
a 89 33 128 21 135 10 136 3 145 6 70 8 67 18 76 33
c 22 20 12 4 11 3 8 5 2 2 55 7 17 14 27 25
g 29 95 10 125 7 141 9 145 3 145 16 132 56 112 28 72
t 16 8 6 6 3 2 3 3 6 3 15 9 16 12 25 26
//
a 69 209 20 330 17 336 16 347 29 222 61
c 222 40 339 8 345 7 348 3 319 39 194
g 32 71 9 28 9 22 8 15 14 48 55
t 55 58 10 12 7 13 6 13 16 69 68
//
a 16 10 5 2 0 1 37 3 0 41 9 9
c 11 15 4 1 44 0 2 39 5 0 20 10
g 10 10 33 38 0 43 1 1 36 3 6 17
t 7 9 2 3 0 0 4 1 3 0 9 8
//
a 18 20 2 5 2 6 77 2 7 28 19
c 24 28 2 2 82 3 2 78 66 16 28
g 20 11 80 77 2 75 5 4 6 33 18
t 25 28 3 3 1 3 3 3 8 10 22
//
a 28 35 25 66 10 75 2 2 3 76 76 30 34
c 16 12 22 8 64 0 4 79 1 3 1 15 11
g 20 19 20 5 6 3 75 2 78 4 4 17 20
t 19 17 16 4 3 5 2 0 1 0 2 21 18
//
a 43 110 39 103 16 182 14 186 8 183 10 168 39 105
c 28 30 22 35 4 8 3 9 4 11 1 15 25 31
g 113 31 130 31 183 6 186 6 193 7 194 14 120 41
t 23 36 16 38 4 11 4 6 2 6 2 10 23 30
//
a 26 32 8 3 5 11 1 2 90 28 24
c 35 17 5 103 1 5 113 3 14 33 34
g 33 34 8 2 106 5 2 109 6 26 27
t 23 34 96 9 5 96 1 3 7 30 32
//
a 28 36 5 7 3 2 7 6 5 34 22
c 39 19 130 8 3 140 112 7 139 38 35
g 34 58 4 2 139 2 8 133 5 26 52
t 50 38 12 134 6 7 24 5 2 53 42
//
a 22 26 62 62 62 0 62 0 29 12
c 10 8 0 0 0 0 0 0 15 13
g 18 23 0 0 0 62 0 62 10 27
t 12 5 0 0 0 0 0 0 8 10
//
a 34 14 53 5 55 1 61 0 61 3 34 2 30 7 51 7 36 17 29 15
c 18 6 5 1 6 0 4 2 1 2 22 3 28 5 7 27 5 15 13 7
g 12 44 6 60 3 66 1 65 2 61 5 61 6 51 5 28 18 29 14 35
t 3 3 3 1 3 0 1 0 3 1 6 1 3 4 4 5 8 6 11 10
//
a 15 11 6 3 0 1 0 52 0 6 8 18
c 11 9 10 2 0 56 2 0 1 30 6 13
g 22 14 35 0 57 1 55 1 57 7 30 14
t 10 24 7 53 1 0 1 5 0 15 14 13
//
a 74 55 170 28 170 11 172 6 168 50 76
c 29 61 6 13 5 8 1 161 6 46 20
g 40 39 2 125 6 6 7 6 4 35 28
t 40 28 5 17 2 158 3 10 5 52 59
//
a 12 3 5 5 6 0 1 0 1 3 39 1 20 5
c 16 20 24 21 4 44 0 44 1 41 0 36 10 24
g 4 13 4 16 8 0 1 0 40 0 0 4 7 10
t 14 10 13 4 28 2 44 2 4 2 7 5 9 7
//
a 10 6 0 0 0 0 25 25 11 4
c 4 4 25 0 0 0 0 0 7 7
g 4 6 0 25 25 0 0 0 4 6
t 7 9 0 0 0 25 0 0 3 8
//
a 16 13 37 0 37 0 0 0 14 11
c 8 13 0 37 0 37 0 37 7 13
g 6 6 0 0 0 0 0 0 11 7
t 7 5 0 0 0 0 37 0 5 6
//
a 56 64 154 154 154 0 154 154 84 71
c 32 35 0 0 0 154 0 0 23 29
g 32 22 0 0 0 0 0 0 25 25
t 34 33 0 0 0 0 0 0 22 29
//
a 26 24 24 10 15 3 12 3 5 1 2 3 4 4 7 6 14
c 24 63 20 109 20 130 12 134 3 136 6 132 7 120 13 82 25
g 17 27 21 11 45 6 53 3 5 6 8 2 10 4 9 19 26
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//
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